2024年3月15日发(作者:)
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光明中医
2021
年
3
月第
36
卷第
6
期
CJGMCM March 2021. Vol 36.6
基于网络药理学研究胆舒胶囊治疗慢性
胆囊炎的机制
冯炜业柯路琳
A
摘要:目的探究胆舒胶囊医治慢性胆囊炎的分子机制。方法胆舒胶囊中主要活性成分是薄荷素油,其为薄荷的挥发油。
因此本研究依托
TCMSP
数据平台,以
OB
530%和
Dl
^
O
. 18为条件,同时结合文献筛选薄荷的有效活性成分,集合疾病靶点数据
库探究薄荷治疗慢性胆囊炎的靶点。利用
String
平台获得交集靶点
PPI
网络
,Cytoscape
3. 7. 2软件绘制“薄荷-有效活性成分-交
集治疗靶点-疾病”网络,
R
语言软件及
clusterProfiler
等数据包对治疗靶点进行
GO
富集分析及
KEGG
通路分析。结果从薄荷中
筛选得到12个有效活性成分,药物有效活性成分与疾病的交集靶点共36个,其中关键乾点包括
VEGFA
、
AKT
1、
EGFR
、
TNF
、
MAPK
3、
PTGS
2、
MMP
9、
MMP
2、
MP
0、
HIF
1
A
等;分别参与了细胞对氧化的应激反应、对金属离子的响应、平滑肌细胞增殖的正调控、
肢原代谢等生物进程;分析结果涉及癌症、
TNF
、
RelaXin
、磷酸酯酶
D
、
VGEF
、
HIF
-1等信号通路。结论研究分析结果显示胆舒肢囊
经过多组分-多靶点-多通路发挥治疗作用,可能主要通过抗炎镇痛、解痉、利胆、抗菌等方面来治疗慢性胆囊炎。
关键词:胆舒肢囊;薄荷;慢性胆囊炎;网络药理学
doi
:
10. 3969/j. issn. 1003-8914.2021.06.006
文章编号:
I003-8914(2021)-06-0864-05
慢性胆囊炎为相当常见的消化系统疾病,多由胆
结石所致胆囊壁炎症,或胆汁瘀积、感染导致急性胆囊
炎反复发作拖延不愈而致[1]。这几年,中医药在医治
慢性胆囊炎上发挥了重要作用,在一定程度上补充了
西药治疗疗效不佳的情况。
胆舒胶囊中主要活性成分为薄荷素油,其为新鲜
的唇形科薄荷的茎和叶经一系列加工获得的挥发油。
薄荷是传统的食药两用植物,具有抑菌、抗炎、止痛、抗
癌、解痉等生物活性,临床上可将其为单方或复方治疗
慢性胆囊炎,但在薄荷治疗慢性胆囊炎的分子机制上
的研究报道甚少。本文基于网络药理学方法,筛选出
胆舒胶囊中君药薄荷的主要有效活性成分和发挥作用
的靶点,探究慢性胆囊炎的已知疾病靶点,分别绘制
件;
clusterProfiler
等数据包等。
2方法
2.1主要活性成分及作用靶点的筛选基于
TCMSP
平台,“薄荷”为关键词,选择口服生物利用度(〇
B
)>
30%并且类药特性(
DL
) >0. 18作为筛选条件[2],同
时结合杨倩[3]的报道,获得相关的化合物成分。将筛
选后的化学成分导人
Pubchem
服务器,得到化学成分
2
D
结构的
SDF
文件。最后,运用
Swiss
target
predict
数据库,导人化学成分的
SDF
文件,选择物种为“智
人”,选择
Probability
值> 0的耙点,剔除未获得耙点
的成分,剔除重复靶点,获取活性成分靶基因,并经过
Uniprot
蛋白数据库对靶基因进行注释。
2.2疾病
|E
点的收集分别在
GeneCards
及0
MIM
数据库、以“
chronic
cholecystitis
”为关键词,搜集与慢
性胆囊炎发病的相关靶基因,合并2个数据库疾病靶
点,剔除重复值,获得慢性胆囊炎疾病靶点。
2.3
PPI
网络图的绘制与分析运用
Venny
2. 1.0
软件将薄荷活性成分靶点与慢性胆囊炎疾病靶点进行
交集,得到胆舒胶囊医治慢性胆囊炎的治疗靶点。将
获得的治疗靶点上传
String
在线数据库,得到蛋白互
作网络,并对网络图中的核心基因进行分析。
2.4 “薄荷-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病”
网络图的构建将薄荷、有效活性成分、交集治疗靶
点、疾病间相互关系导人
Cytoscape
3.7.2软件,构建
“薄荷-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病”网
络图。
2.5
GO
与
KEGG
富集分析依托
Bioconductor
数
PPI
及“薄荷-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病”
网络图,并进行分析;依托
Bioconductor
数据库,运用
R
语言软件及
clusterProfiler
等数据包对粑点基因本体
(
GO
)的生物进程(
BP
)、分子功能(
MF
)、细胞成分
(
CC
)3个水平及
KEGG
信号通路进行分析,为胆舒胶
囊治疗慢性胆囊炎分子机制的进一步探索提供参考。
1材料
TCMSP
数据分析平台;
Pubchem
数据库
;Swiss
target
predict
数据库
;GeneCards
数据库;0
MIM
数据
库;
Uniprot
数据库;
String
数据库
;Venny
2. 1. 0软件;
Cytoscape
3. 7. 2 软件
;Bioconductor
数据库
;R
语言软
作者单位:福建医科大学附属第一医院药学部(福建福州350005)
A
通讯作者:
:44437449@
.
com
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.
据库,
R
语言软件及
clusterProfiler
等数据包对胆舒胶
囊治疗靶点的生物进程、分子功能、细胞成分3个水平
进行
GO
富集分析;同样方法进行
KEGG
富集分析,
R
语言绘制
KEGG
信号通路富集分析高级气泡图,以揭
示胆舒胶囊治疗慢性胆囊炎的分子机制。
3结果
3.1药物靶点及疾病靶点的确定
TSMCP
平台检索
得到薄荷化学成分有164个,符合筛选条件的化学成
分10个,分别为金柑苷、金合欢素、蒙花苷、豆留醇、谷
甾醇、柚皮素、芦荟大黄素、圣草酚、芫花素、木犀草素;
结合文献报道薄荷挥发油含量高的4个活性成分,分
别是
L
-薄荷酮、胡椒酮
、L
-薄荷醇、胡薄荷酮;在
Swiss
target
predict
数据库剔除未获得成分对应耙点的
芦荟大黄素以及未与疾病靶点获得交集的胡薄荷酮,
筛选出薄荷化学成分12个,薄荷作用靶点270个,见
表1。经过
GeneCards
与
OMIM
数据库检索,整合获得
慢性胆囊炎疾病靶点502个,运用
Vermy
2_ 1.0软件
取薄荷与慢性胆囊炎疾病靶点交集,见图1。得到治
疗靶点36个,见表2。
表1薄荷关键化合物
口服生
ID
用
药物相相对分
序号
英文名称
活性成分物利
度/%
似性子量
1
MOL
011616
fortunellin
金柑苷
35.650. 74592.60
2
MOL
001689
acacetin
金合欢素
34.970.24284.28
3
MOL
001790
linarin
蒙花苷
39. 840.71592. 60
4
MOL
002881
diosmetin
香叶木素
31. 14
0. 27300. 28
5
MOL
000359
sitosterol
谷甾醇
36.910. 75
414.79
6
MOL
004328
naringenin
袖皮素
59.290. 21272. 27
7
MOL
005190
eriodictyol
圣草酚
71.790.24
288. 27
8
MOL
005573
genkwanin
芫花素
37. 130. 24
284. 28
9
MOL
000006
luteolin
木犀草素
36. 160. 25286.25
10
MOL
0007151
-menthone
L
-薄荷酮
57.900.03154.28
11
MOL
007330
menthol
L
-薄荷醇
43.310. 03156.28
12
MOLO
11848
d-piperitone
胡椒酮
48. 750. 03
152. 26
薄荷靶点 慢性胆囊炎靶点
图1韦恩图
表2薄荷治疗慢性胆蠹炎的关键靶点
序号
基因符号
序号基因符号
序号
基因符号
1
TNF
13
MMP
225
CYP
2
C
9
2
XDH
14
TERT
26
PIK
3
CA
3
AKR
1
B
1
15
EGFR
27
F
3
4
CA
916
F
228
VEGFA
5
PTGS
217
DAPK
129
CTSL
6
LGALS
318
MP
0
30
HIF
1
A
7
ABCB
1
19
MMP
331
TYMP
8
KIT
20
AKT
132
PIK
3
CG
9
CFTR
21
G
6
PD
33
SHH
10
ARG
122
SLC
6
A
434
NR
1
H
4
11
GL
01
23
PPARG
35
SLC
6
A
3
12
MMP
9
24
PTGS
1
36
MAPK
3
3.2
PPI
网络将治疗靶点上传String数据库,物种
设置为“智人”,选择medium confidence(0. 400),隐藏
离散点,得到靶点相互作用网络图,见图2。其中节点
代表治疗靶点,“边”代表治疗靶点之间的关联,其粗
细用结合分数表示,“边”越粗结合分数值越大,代表
其结合度越大。由
R
语言软件绘制出节点数排名前
20的核心基因条形图,横坐标为节点数,纵坐标为基
因symbol。见图3。
图2薄荷靶点蛋白相互作用网络图
图3蛋白互作核心基因柱状图
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3.3 “薄荷-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病”
网络图应用
Cytoscape
软件构建薄荷治疗慢性胆囊
炎的药物-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病相互
作用网络图,从而间接体现了胆舒胶囊治疗慢性胆囊
炎多组分、多靶点协同作用的特点。见图4。
3. 4 GO富集分析采用
UniProt
数据库对基因
symbol
进行
ID
转换,依托
Bioconductor
数据库,运用
R
语言软件及
clusterProfiler
等数据包,设置
pvalueCutoff
与
qvalueCutoff
的值为0. 05 ,从生物进程、分子功能、
细胞成分3个水平对36个关键靶点进行分类富集分
析,
GO
富集结果包括细胞对氧化的应激反应、对金属
离子的响应、正向调节平滑肌细胞的增殖、胶原代谢过
程等生物进程;蛋白磷酸酶、丝氨酸水解酶活性、过氧
化酶活性等分子功能;膜筏、膜微结构域、肥大细胞颗
粒等细胞成分。
3.5 KEGG富集分析利用上述的基因ID,同样依
托
Bioconductor
数据库,利用
R
语言软件及
clusterProfiler
等数据包,设置
pvalueCutoff
与
qvalueCutoff
的值为0.〇5进行
KEGG
信号通路分析,
包括癌症通路、
TNF
信号通路、
Relaxin
信号通路、磷酸
酯酶
D
信号通路、
VGEF
信号通路、缺氧诱导因子1信
号通路等代谢通路。取排名前20的
KEGG
信号通路
绘制高级气泡图。见图6。
图4薄荷-有效活性成分-交集治疗靶点-疾病
相互作用网络图
Proteoglycans In cancer
Bladder cancer
Central carbon metabolsm in cancer
AGE-RAGE slgnalng pathway In diabetic compications
TNF signaling pai^ay
Rdaxin signaling pathway
Ruid shear stress and atherosclerosis
Phospholipase D signaling pathway
Gastric cancer
Kaposi sarcoma-assoclaled herpesvirus infection
Prostate cancer
Endocrine resistance
HIF-1 signaling pathway
Platelet activation
Autophagy - animal
VEGF signaling pathway
Acute mydoid leukemia
Renai cel! carcinoma
Pancreatic cancer
EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance
•
•
•
•
•
•
0.150*20 0.25
GeneRatio
图6
KEGG
通路富集分析高级气泡图
4讨论
网络药理学对药物治疗疾病的靶点、通路等可以
醇、柚皮素、圣草酚、芫花素、木犀草素、
L
-薄荷酮、
L
-薄
荷醇、胡椒酮。现阶段发现金合欢素具备多重生物活
性,如抑菌、抗炎、抗癌、抗氧化、免疫调节等效用:4]。
蒙花苷可以通过调节炎性因子与炎性介质的水平而产
生抗炎镇痛作用[51。谷留醇的抗炎机制可能是通过
从分子水平上预测,故本文通过该策略研讨胆舒胶囊
医治慢性胆囊炎的分子机制,结果获得12个主要活性
成分,分别为金柑苷、金合欢素、蒙花苷、豆留醇、谷甾
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抑制炎症介质
PGE
2、缓激肽、组胺、5-
HT
等的活性来
抑制游离细胞的迁移[6]。豆留醇和圣草酚具有抗氧
化、抗肿瘤、抗炎症等药理活性。
L
-薄荷酮、
L
-薄荷醇、
胡椒酮为薄荷挥发油中含量高的主要成分,它们可通
过干预消化道钙离子的跨膜运动产生解痉、使消化道
平滑肌松弛,形成利胆作用[7]。周露[8]的研究表明薄
荷挥发油具有显著的抗大肠埃希氏菌、嗜肉菌、白假丝
酵母菌等菌株活性。
药物与疾病的交集靶点36个,包括
VEGFA
、
AKT
1、
EGFR
、
TNF
、
MAPK
3、
PTGS
2、
MMP
9、
MMP
2、
MP
0、
HIF
1
A
等,主要涉及血管生成、炎症反应、癌症进
展、细胞凋亡及氧化应激等生理病理进程。在
VEGFRA
-
VEGFR
2信号蛋白通路中,
PI
3
K
下游信号的
AKT
激活后,通过下游的
Bad
、
mTORCl
、
FOXO
、
GSK
-
3
p
、
eN
0
S
等靶分子调节细胞凋亡和血管通透性、参与
血管生成和浸润转移相关的炎症反应。表皮生长因子
受体(
EGFR
)是影响局部上皮组织新生血管修复和内
皮细胞形成的重要因素,其可以参与癌症、炎症、免疫
疾病的进展^
EGFR
是
EGF
与
TGF
-
ct
受体;同时,相
关研究表明,
EGFR
可导致胆固醇核化过程异常,促使
胆结石的形成[9]。因此,我们推测,薄荷中的有效活
性成分可与
EGFR
相互作用,阻断促炎因子与
EGFR
结合,起到抗炎作用,同时抑制胆结石的形成。肿瘤坏
死因子
(Tumor
necrosis
factor
,
TNF
)是一■类可诱导细
胞凋亡的因子,可由多种细胞分泌表达,其生物学功能
主要包括细胞凋亡、诱导炎症反应和免疫调节等。
TNF
-
a
细胞因子处于家族中最重要的地位,主要通过
对
MAPK
、
NF
-
k
B
、
ERK
等信号通路的上调,起诱导细
胞凋亡和促炎作用[1°]。
MAPK
靶点同样与肿瘤、炎
症、氧化应激密切相关["],磷酸化的
P
38
MAPK
可激活
许多底物如转录因子、胞浆与胞核内蛋白、蛋白激酶
等,诱导炎症反应、细胞的分化、周期停滞、衰老、凋亡、
细胞因子的产生和
RNA
剪接的调控等,且这种活化作
用通常具有组织细胞特异性。前列腺素内过氧化物合
酶(
PTGS
2)作为环氧酶途径中的双功能酶,作为前列
腺素中氧化酶的还原酶,具备
C
0
X
与过氧化酶活性,
可将花生四烯酸催化成前列腺素,推测薄荷活性成分
可能通过抑制
PTGS
2以达到抗炎、镇痛效果
。MMPs
是肽链内切酶,它能够降解细胞外基(
ECM
)的组成成
分,
MMP
9、
MMP
2可促成肿瘤新生血管的形成,导致血
管局部基底膜降解,创造促进血管生成,促进肿瘤细胞
侵袭转移的微环境[12]。髓系细胞中的髓过氧化物酶
(
MP
0)遇到病原体后,骨髓细胞可以产生过量的
H
202,
MP
0与
H
202等氧化剂发生过氧化反应和正卤
化反应,产生杀菌能力很强的次氯酸(
HC
10),可引起
蛋白质破裂、
DNA
变性和氨基酸分解等病理过程"3、
缺氧诱导因子
l
(
HIF
-
l
)作为一种由机体在缺氧时产
生的依赖氧的转录激活物,诱导
VEGF
、促炎黏附分子
和趋化因子的表达,调节机体适应缺氧环境。
经过
GO
及
KEGG
富集结果分析可知,
GO
富集分
析发现关键靶点参与细胞的氧化应激反应、金属离子
的响应、正向调节平滑肌细胞的增殖、胶原代谢过程等
生物进程;蛋白磷酸酶、丝氨酸水解酶活性、过氧化酶
活性等分子功能;膜筏、膜微结构域、肥大细胞颗粒等
细胞成分。
KEGG
富集分析提示胆舒胶囊主要是通过
癌症、
TNF
、
Relaxin
、磷酸酯酶
D
、
VEGF
、
HIF
-1等信号
通路发挥协同作用。
HIF
-1通路水平的变化与
AKT
,
NF
-
k
B
通路有关,还可诱导
VEGF
的转录,为干预炎症
损伤、氧化应激、凋亡、肿瘤的重要信号通路[14]。薄荷
活性成分可通过
Relaxin
信号通路发挥抗炎作用:
relaxin
-2可以抑制
TNF
-
a
诱导的单核细胞对血管内皮
细胞的粘附[15]。
综上所述,本文初次运用网络药理学的策略研究
胆舒胶囊医治慢性胆囊炎分子机制,提示其可能通过
抗炎镇痛、解痉、利胆、抗菌等方面来治疗慢性胆囊炎;
成功地预测了胆舒胶囊治疗慢性胆囊炎主要作用的靶
点与相关的信号通路,发现胆舒胶囊经过多组分-多
靶点-多通路发挥医治作用,为后续的实验研究等提
供参考。
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cancers
,
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tumor
associated
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acid
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健脾和胃汤对慢性胃炎患者胃肠功能及
免疫功能的影响
宋永玲
摘要:目的观察健脾和胃汤对慢性胃炎患者疗效,分析其对患者胃肠功能及免疫功能的影响。方法选择2018年1月一
2019年6月接受诊治的100例
HP
阳性慢性胃炎患者,使用随机数字表法分为对照组(50例)和观察组(50例)。对照组采用“四
联”疗法,即奥美拉唑片、阿莫西林肢囊、克拉霉素片和枸橼酸铋钾肢囊;观察组加用健脾和胃汤。2组均连续治疗14
d
。记录治疗
前后2组患者胃肠道症状评定量表(
GSRS
)评分、胃肠道症状积分问卷(
GIS
)评分,检测治疗前后患者血清
CD
3+、
CD
4+、
CD
8+的
指标。结果治疗后观察组
GSRS
评分、
GIS
积分低于对照组(
P
<0.05);治疗后观察组血清
CD
3+、
CD
4+、
CD
8 +水平高于对照组,
IgA
、
IgG
水平低于对照组
(P
<0.05);观察组临床疗效高于对照组(/><0.05)。结论健脾和胃汤可以有效治疗慢性胃炎,对慢性
胃炎患者的胃肠功能和免疫功能有着明显的改善作用。
关键词:胃脘痛;慢性胃炎;健脾和胃汤;中医药疗法
doi: 10. 3969/j.
issn
.
1003 -8914. 2021.06.007
文章编号
:1003 -8914 (2021) 46-0868 -03
慢性胃炎是指胃黏膜发生慢性炎性病变,常发
于急性胃炎后,最常见的病因是
Hp
感染,烟酒、药
物、饮食不规律也能引发慢性胃炎。现代人生活节
奏不断加快,慢性胃炎的发病率逐年增高〜。传统
临床治疗慢性胃炎采用“四联”疗法,即一种抑酸药
物加2种抗生素加一种胃黏膜保护剂。“四联”疗法
具有极强的杀菌作用,能根治幽门螺杆菌
(Hp
)感
染,但“四联”疗法会刺激胃肠道黏膜,引起呕吐、腹
泻等严重的胃肠道不良反应,且服用大量抗生素,会
造成内分泌失调,影响机体的免疫功能,因此“四联”
疗法需要联合其他药物使用降低毒副作用[2]。健脾
和胃汤具有疏肝解郁、健脾和胃的作用,经临床观察
健脾和胃汤在慢性胃炎的治疗上有着良好的疗效,
且药性温和,不良作用小[3]。本次研究将联合使用
健脾和胃汤和“四联”药物治疗慢性胃炎患者,观察
健脾和胃汤治疗慢性胃炎的疗效,和对患者胃肠功
能及免疫功能的影响。
1资料与方法
1.1 —般资料选择2018年1月一2019年6月在医
院接受诊治的
Hp
阳性慢性胃炎患者100例,用随机
数字表法分成观察组50例和对照组50例。对照组中
男性患者25例,女性患者25例;平均年龄(39.55 ±
8. 29)岁;病程1 ~ 10个月,平均病程(6. 72 ±2. 18)个
月。观察组中男性患者24例,女性患者26例;平均年
龄( 39.20 ± 8.04)岁;病程1 ~ 10个月,平均病程
(6. 34 ±2. 34)个月。2组患者性别、年龄、病程等一般
资料比较,差异无统计学意义
(P
>〇.〇5),具有可
比性。
1.2诊断标准西医诊断标准参照《中国慢性胃炎
共识意见(2017年,上海)》[4]:①临床上出现上腹痛、
消化不良等症状。②内镜检查显示胃黏膜红斑、出血
或红白相间、皱襞变平,以及胃黏膜糜烂,胆汁反流等
现象。③血清抗体检测显示
HP
阳性。中医诊断标准
参照《慢性胃炎中西医结合诊疗共识意见(2011年天
作者单位:安阳市第=人民医院消化内科(河南安阳455000)
通讯方式:
E
-
:
zzl
526344@ 163.
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津)》[5]:①临床上出现上腹灼热胀痛等症状。②舌
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