2024年5月6日发(作者:office2010激活不了)
随着Omicron的疯狂变异冠状病毒显示出趋同进化的第一个
迹象
在过去的几个月里,追踪新出现的SARS-CoV-2变种的研究人员
开始注意到一些奇怪的事情。没有一个新的变异体看起来像在接管,
而是各种不同的亚变体似乎正在积累相同的突变。这些突变似乎都在
以一种方式汇聚,以逃避我们原有的免疫力,最近出现了一项引人注
目的研究,推测该病毒有可能完全逃避我们目前的免疫反应。9月,一
个词开始频繁出现在引用K444T和N460K的RBD突变的编码对话
中。这个词就是'融合'。
在过去的两年里,SARS-CoV-2的演变至少可以说是很奇怪。在
整个2020年,专家们经常警告说这种新型冠状病毒有可能发生变异,
但最初,它仍然明显没有变化,直到年底出现了三个变种。
阿尔法、贝塔和伽马都突然出现了。三个不同的品系,在世界的
三个不同地区。所有这些都有相对相似的变异。
变化已经开始,在2021年,我们看到一系列的感染波穿过世界,
每一个都是由一个新的变体驱动的。这些连续的浪潮中特别不寻常的
是,每一个后续的变体都与之前的变体不同。这不是一个单一品系慢
慢变异和变化的情况,而是发生了大的进化飞跃,新的品系突然出现
了。
自从Omicron在2021年底和2022年初袭击以来,大流行病的
路径似乎已经改变。Omicron的品系没有发生大的进化飞跃,而是分
裂成几十个不同的亚型。
Omicron最初出现时有三个相对独立的分支(BA.1、BA.2和
BA.3),但现在这种病毒的特点是有一系列令人头晕的亚型。而自从
最近的BA.5浪潮以来,似乎没有任何一个亚变体占主导地位。相反,
研究人员正在观察所有这些不同的亚变体慢慢地开始采取类似的形式,
同样的突变似乎在多个独立的进化途径中取得成功。
在进化生物学的世界里,趋同进化理论解释了完全不相关的生物
体如何能够分别进化出令人难以置信的相似特征。当面临相同的选择
压力时,截然不同的生物体最终往往会有令人着迷的相似之处。
最常被引用的趋同进化的例子之一是鲨鱼和海豚身体之间惊人的
相似性。这两种生物没有共同的祖先,但它们在面临相同的选择压力
的基础上进化成了相似的样子。
就SARS-CoV-2而言,我们中的许多人可能对有关该病毒独特的
尖峰蛋白的听闻很熟悉。这是一种高度可识别的蛋白质,已有的被证
明成功的疫苗使用它来产生保护性免疫反应。穗状蛋白的一个部分被
称为受体结合域(RBD)。它位于蛋白质的顶部,帮助病毒附着在人
体细胞的某些受体上,这是一个在我们体内感染和复制的关键过程。
最初的疫苗使用的是2020年采自武汉的冠状病毒的一个样本,它
对目前有许多突变的Omicron变体仍然非常有效,因为直到现在,
RBD的变化还非常少。
最近的一项研究(可作为预印本,尚未经过同行评审或发表在期
刊上)提出了一组引人注目的数据,表明一些新的Omicron亚变体都
出现了类似的受体结合域的突变。在给新图集的一封电子邮件中,该
论文的通讯作者曹云龙解释说,多个独立变体的类似突变表明SARS-
CoV-2正在成功地找到逃避我们目前免疫的方法。
'RBD收敛进化,意味着最近出现的SARS-CoV-2 Omicron品系
所进化的RBD突变在相同的位点(热点)上收敛,包括R346、K444、
V445、G446、N450、L452、N460、F486、F490和R493,'曹解
释说。'看到这种趋同的进化模式将意味着SARS-CoV-2将比以前更频
繁地进化出免疫破坏性的突变,而由此产生的新变体将具有更大的免
疫破坏性。'
9月中旬,曹和他的同事们的研究初稿发表在一个预印本服务器上。
与此同时,在一个偶然的研究融合案例中,Twitter上的变体追踪者同
时报告了类似的发现。
一位研究人员称其为'大融合',因为变体追踪者不断报告说在完全
不同的子变体中发现了类似的突变。作为聚合进化的一个例子,
SARS-CoV-2似乎发现某些突变是普遍成功的。
密苏里大学的微生物学家马克-约翰逊(Marc Johnson)是第一
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