2024年5月15日发(作者:联想b460e笔记本配置参数)
酵母系列大实验设计
PCR介导的酿酒酵母基因敲除
1、 实验目的
学习理解酿酒酵母中PCR介导的基因一步敲除法的原理,掌握酵
母的转化方法,了解酵母生长及遗传学特性。
2、 实验原理
酵母菌作为最简单的真核生物,能以单倍体和二倍体两种形式稳
定存在,其中单倍体含有两种交配型,可以自由的在单倍体和二倍体
之间进行转换,在生物学研究中有着得天独厚的优势。
首先酵母菌生长速度很快。对数期生长的单倍体菌株在YPD(富
营养天然培养基)90分钟分裂一代,在合成培养基中140分钟分裂一
代。其次,酵母的基因组很小,遗传背景相对简单,是一种很容易进
行遗传操作的模式生物。酿酒酵母的基因组只有12052 Kb,其基因组
序列早在1996年测序完成,已有约6000个超过100个氨基酸的ORF被报
道,只有不到5%的ORF含有内含子,其中有约5700个蛋白编码基因,
分散在16条染色体上。上世纪90年代末,由数个实验室联合进行的酿
酒酵母基因组敲除项目的完成是酵母遗传学研究的里程碑事件。在这
个项目中,四个基因敲除菌株库被成功构建:两种交配型的单倍体菌
株库、杂合子二倍体菌株库以及非必需基因的纯合子二倍体菌株库。
这个项目几乎完成了全部ORF的敲除,为生物学研究,特别是组学研
究,提供了十分强大的系统性研究工具,为后续基因功能的研究奠定
了坚实的基础。此外,酵母作为真核生物,与高等生物在很多代谢通
路和蛋白表达调节等方面是高度保守的,为高等生物相关基因,例如
疾病基因,功能研究具有提供了简单、易于操作的系统。
目前,酿酒酵母已经具有一套十分灵活快速的遗传操作体系。酵
母允许外源质粒以独立复制子游离于基因组之外存在,也允许其整合
到基因组中。但跟其他生物相比,酵母比较独特且强大的特点是外源
序列的整合依赖于同源重组机制。之前提到的基因组敲除项目的完成
就是依赖于高效率的同源重组,如图-1所示。人们利用PCR的方法,
在筛选标记基因两侧引入待敲除基因(YFG,your favorite gene)
特异性序列;随后将PCR产物通过转化传递到酵母细胞内部;在同源
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