charge综合征2例报告并文献复习

charge综合征2例报告并文献复习


2024年3月12日发(作者:)

· 898 ·

doi:10.3969/.1000-3606.2019.12.005

临床儿科杂志 第 37 卷第 12 期 2019 年 12 月

J Clin Pediatr Vol.37 No.12 Dec. 2019

CHARGE综合征2例报告并文献复习

杨 莹 刘 毓 文 静 邓婉玲 马春元 邵晓珊

贵州贵阳 550003

贵阳市妇幼保健院 贵阳市儿童医院内分泌遗传代谢科

摘要:方法 

回顾分析2例确诊因

CHD7

基因变异导致CHARGE 

目的

 探讨CHARGE综合征的临床特征及诊断

CHARGE综合征

CHD7

基因

综合征患儿的临床资料

并以为关键词

检索PubMed

HGMD

中国知网及万方数据库

结果 

2例男性患儿分别为4月余

1998年1月

2018年6月收录的文献进行复习

8岁2个月

均表现为生长发育缓慢

伴有听力障碍

动脉导管未闭

例1伴有视力障碍

例2伴睾丸隐匿

基因检测例1为

CHD7

基因第29外显子c.5883C>T

1945*

)(

p.C989Y

杂合无义变异

例2为

CHD7

基因第12外显子c.2966G>A杂合变异

例1患儿

CHD7

位点突变

导致编码的

CHD7

蛋白截短而致病

例2患儿

CHD7

位点变异

除本身可能导致的错义突变致病外

也可能导致SRp55蛋

TGCATT

白结合的ESE位点消失

影响pre-mRNA剪接的准确率

进而影响CHD7蛋白的功能

共检索到

CHD7

基因相

结论 

CHARGE综关CHARGE综合征文献107篇

涉及到1 021例患者

HGMD收录的

CHD7

基因突变数据共计817个

CHD7

基因检测有助于诊断

合征表现多样

涉及多系统

关键词:

 CHARGE综合征

 

CHD7

基因

 临床特点

 外显子剪接增强子

CHARGE syndrome: report of 2 cases and literature review

 

YANG Ying, LIU Yu, WEN Jing, DENG Wanling, MA

Chunyuan, SHAO Xiaoshan (Department of Hereditary Endocrinology and Metabolism, Maternal and Child Health-Care

Hospital in Guiyang, Guiyang 550003, Guizhou, China)

Abstract:

 

Objective

 

To explore the clinical characteristics and diagnosis of CHARGE syndrome. Methods

 

The clinical

data of CHARGE syndrome due to CHD7 gene mutation in two children were analyzed retrospectively. The databases of PubMed,

HGMD, CNKI, and WanFang were searched from January 1998 to June 2018 with the key words of "CHARGE syndrome and CHD7

gene" and the literatures were reviewed. Results

 

Two boys were over 4 months old and 8 years and 2 months old respectively. Both

of them showed slow growth and development retardation, with hearing impairment and patent ductus arteriosus. In addition case 1

had visual impairment and case 2 had occult testis. Genetic analysis showed that the case 1 carried a heterozygous nonsense mutation

of c.5883C>T (1945*) in the 29th exon of CHD7 gene, and case 2 carried a heterozygous mutation of c.2966G>A (p.C989Y)

in the 12nd exon of CHD7 gene. In case 1, CHD7 mutation led to the truncation of the encoded CHD7 protein, which caused the

disease. In case 2, the CHD7 mutation may not only cause missense mutation itself, but may also cause the disappearance of the ESE

(TGCATT) site bound by SRp55 protein, affecting the accuracy of pre-mRNA splicing, and thereby affecting the function of CHD7

protein. A total of 107 articles on CHD7 gene causing CHARGE syndrome were retrieved and covered 1021 patients. There were 817

mutations data of CHD7 gene collected in HGMD. Conclusions

 

The symptoms of CHARGE syndrome are diverse and involve

multiple systems. The CHD7 gene detection is helpful for the diagnosis of CHARGE syndrome.

Key words:

 

CHARGE syndrome;

 

CHD7 gene;

 

clinical feature;

 

exon splicing enhancer

OMIM 214800

CHARGE综合征是一种多发性

畸形综合征

其特征主要包括眼部缺损

后鼻孔闭锁

颅神经缺损

独特的内耳或外耳畸形

听力丧失

心血

近年来

管畸形

泌尿生殖系统异常或生长迟缓

[1-3]

报道的

CHD7

基因突变是导致CHARGE综合征的主

要原因

目前中国鲜有CHARGE综合征报道

本文对

通信作者:邵晓珊 电子信箱:58367670@

2017

2018年收治的2例CHARGE综合征患儿的临

床表现及其诊断经过进行总结

并复习相关文献

1 临床资料

例1

4月余

因生长发育缓慢2个月就诊于

贵阳市妇幼保健院小儿内分泌遗传代谢门诊

患儿为

临床儿科杂志 第 37 卷第 12 期 2019 年 12 月

J Clin Pediatr Vol.37 No.12 Dec. 2019

· 899 ·

G3P1

出生体质量2.2 kg

身长48 cm

足月剖宫产

无产伤及窒息史

新生儿听力及视力筛查异常

母亲

既往有过2次不明原因流产史

父母及同父异母姐姐

体健

体格检查

身高53 cm

<

P

3

),

体质量5.0 kg

<

P

3

),

头颅五官基本对称

双眼角下塌

不会追物

耳廓呈

圆弧形

多毛

耳位低

胸廓畸形

呈漏斗状

肺部可

闻及喉传导音

心前区可闻及II/VI级收缩期吹风样

杂音

无明显传导

六指畸形

阴茎外露细小

长约

1.5 cm

直径约1 cm

左侧阴囊可扪及睾丸约1 mL

右侧阴囊空虚

未扪及睾丸

右腹股沟区可扪及睾丸

样物0.5 cm

×

0.3 cm

×

0.3 cm

串联质谱检查无异常

心脏B超示动脉导管未闭

继发孔型小房缺

头颅磁

共振成像

MRI

示双侧苍白球对称性短T1信号

例2

8岁2个月

因生长发育缓慢7年就诊于

贵阳市妇幼保健院小儿内分泌遗传代谢门诊

就诊前

7年家长发现患儿身高

体质量明显落后于同龄儿

发声低

语言发育落后

因先天性耳聋安装助听器

现可简单语言交流

5年前发现睾丸隐匿

外科行睾丸

下降固定术

出生时曾被诊断动脉导管未闭

18个月

复查已自愈

患儿为G2P2

足月剖宫产

无产伤及窒

息史

父母体健

体格检查

身高120.2 cm

P

3

~

P

15

),

体质量22.5 kg

P

3

~

P

15

)。

五官基本对称

耳小呈圆形

耳位低

肺部可闻及喉传导音

阴茎外露细小

长约

2 cm

直径约1 cm

双侧睾丸可扪及约1 mL

提睾反

射存在

辅助检查

头颅MRI示双侧脑室稍丰满

六脑室显示

染色体检查为46

XY

睾酮0.01

μ

g/L

经医院医学伦理审核及监护人知情同意

取患儿

及父母外周血

由第三方检验完成基因测序

采用二

代高通量测序

并经Sanger验证

结果发现

例1患

CHD7

NM_017780

基因第29外显子c.5883C>T

1945*

为杂合无义变异

其父母均未发生变异

图1

),

根据ACMG指南的致病性分析该变异为强致

病等级

例2患儿

CHD7

NM_017780

基因第12外显

子c.2966G>A

p.C989Y

杂合变异

其父母均未发生

变异

图2

),

根据ACMG指南的致病性分析该变异为

疑似致病性变异

2 讨论

CHARGE syndrome

CHD7

为关键词

检索

PubMed数据库1981

2018年6月的相关文献

共检

出130篇文献

其中综述11篇

耳聋/植入耳蜗相关文

献21篇

CHD7

基因相关CHARGE综合征98篇

涉及

到1 021例患者

HGMD收录的

CHD7

基因突变数据

共计817个

其中与CHARGE综合征的相关位点711

图1 例1患儿家系

CHD7

基因检测结果

图2 例2患儿家系

CHD7

基因检测结果

致病位点683个

突变位点中无义突变196个

码突变317个

错义突变81个

剪切突变89个

涉及

CHD7

基因大片段缺失突变15个

大片段插入1个

染色体易位2个

微缺失/微插入10个

中国知网

方数据库共收录文献9篇

CHD7是哺乳动物细胞中ATP依赖性染色质域

解旋酶DNA结合蛋白家族的九个成员之一

2010年

研究者在对非洲爪蟾胚胎的

CHD7

基因敲除实验中

发现了CHARGE综合征的所有特征

证明CHD7在

人类和非洲爪蟾中对起源于外胚层发育的神经嵴形

成的广泛分化潜能与在全身迁移能力的功能至关重

[4]

在小鼠实验中也发现CHD7可作为转录因子与

P53启动子结合起调控作用

进而影响小鼠的发育

[5]

CHARGE综合征的主要致病基因为

CHD7

OMIM

608892

),

为常染色体显性遗传的致病基因

其位于

8q12

全长188 kbp

由38个外显子组成

图3A

),

码2 997个氨基酸

包含6个结构域

图3B

),

分别为

Med15结构域

控制多细胞动物早期发育关键的基因

激活信号转导子

)、

2个CH结构域

约50个保守氨基

酸的染色质结构修饰结构域

主要在真核细胞核的功

能组织中起作用

与蛋白中的组氨酸或RNA的甲基

化调控相关

)、

SNF2家族N端结构域

涉及转录调节

DNA修复

DNA重组和染色质解旋功能

),

以及2个

BRK结构域

通常与解旋酶和转录因子相关

)。

例1患儿的突变位点c.5883C>T位于第29外

显子

该突变导致其编码的精氨酸变为终止密码

1945*

),

致使CHD7蛋白变为截断蛋白

· 900 ·

临床儿科杂志 第 37 卷第 12 期 2019 年 12 月

J Clin Pediatr Vol.37 No.12 Dec. 2019

CHD7

A.

CHD7

基因的外显子模式,红色箭头所示分别为本文2例患

CHD7

基因变异位置;7蛋白包含的结构域,红色箭

头为本文2例患儿氨基酸突变位置;C.不同种属间CHD7蛋

白序列保守性分析,红色箭头处为本文2例患儿突变位点

图3 

CHD7

的结构域及突变位点保守性分析

对其氨基酸位点分析发现

在不同物种中

Mus

NP_001264078.1

)、(

XP_697956.4

)、

DanionSus

XP_020944994.1

)、(

XP_024857592.1

)、

BosCanis

XP_544097.2

)(

图3C

)。

属保守性位点该突变位点

已有报道

曾在110例CHARGE综合征患者中检测到

本例患儿临床有动脉导管未闭

1例c.5833C>T

[6]

发孔型小房缺

耳异常

六指畸形

生殖器异常

符合

[3]

表1

CHARGE综合征的诊断标准

CHD7

CHD7

例2患儿中的突变位点c.2966G>A位于第12外

显子的第9位

该突变导致

CHD7

基因的989位的半

胱氨酸突变为酪氨酸

本例患儿在临床上表现有动

脉导管未闭

外耳异常

生殖器异常

听力障碍及发

育迟缓

也符合CHARGE综合征的诊断标准

目前

在HGMD数据库中发现

CHD7

基因在第12外显子的

c.2966附近位置收录了c.2966delG导致的移码突变

p.C989Sfs*3

c.2959C>T导致的无意义突变R987X

以及c.2958-1G>A

c.2958-2A>T导致的剪接变异

[7-10]

A. reference sequence是

CHD7

野生型即c.2966G(绿色标

注),mutant sequence 是

CHD7

变异型即c.2966G>A(红

色标注);B. 在ESE finder网站中预测结果,左图为

CHD7

c.2966G野生型,右图为

CHD7

c.2966G>A

图4 

CHD7

c.2966G>A突变分析

TGCATT

)(

图4A

),

splice enhancer

区域对突变序列

预测后发现SRp55结合位点被完全破坏

同时经ESE

finder网站预测发现

c.2966G>A突变型SRp55结合

图4B

)。(

pre-mRNA

位点消失前体mRNA进行精

准剪切然后连接在一起

形成正确的成熟mRNA是

基因行使功能的关键

pre-mRNA选择性剪接机制包

括RNA自身调控位点与蛋白相互作用

RNA-RNA碱

基配对相互作用等

引起疾病的突变通常发生在内含

子边界附近的剪接位点或突变导致调节RNA剪接的

外显子或内含子中

沉默子或增强子元件发生破坏

从而造成pre-mRNA的错误性剪接导致编码的蛋白异

而ESE调控的pre-mRNA剪接机制属于RNA-蛋

白互作中的调控范围

ESEs能够被特异性富含丝氨

SR蛋白

酸/精氨酸蛋白serine/arginine-rich proteins

。(

p.C989Y

由于

CHD7

基因 c.2966G>A变异

位点在HGMD中未收录

因此对该氨基酸位点在不

图同种属中进行保守性分析

结果发现其非常保守

。(

/3C

通过Human Splicing Finder

NM_017780

HSF3/

对本例患儿

CHD7

变位点c.2966G>A进行预测分析发现

该变异位点位

ESE

于SRp55蛋白结合的外显子剪接增强子exonic

表1 CHARGE综合征临床诊断标准(2016)

  主要特征

1.先天性缺损

2.后鼻孔闭锁或腭裂

3.外耳、中耳或内耳异常,包括半规管发育不全

4.致病性

CHD7

基因突变

  次要特征

1.颅神经麻痹或脑干功能障碍包括听力障碍

2.吞咽困难/喂养困难

3.脑结构异常

4.发育迟缓/智力障碍/自闭症

5.下丘脑垂体功能障碍(促性腺激素或生长激素缺乏)和生殖器异常

6.器官(心脏和/或食管)畸形

7.肾异常,骨骼/肢体异常

CHARGE综合征诊断:两个主要特征+次要特征(无或多个)

临床儿科杂志 第 37 卷第 12 期 2019 年 12 月

J Clin Pediatr Vol.37 No.12 Dec. 2019

· 901 ·

识别和结合

这是一个结构相关及高度保守的剪接因

例2

子SR家族

SRp55是SR家族中的成员之一

[11]

患者

CHD7

c.2966G>A变异位置位于SRp55蛋白识

别的外显子剪接增强子上

如图4B所示

该变异导致

第12外显子临近剪切位点的ESE破坏

有可能影响

CHD7

转录的pre-mRNA剪接成成熟的mRNA准确率

进而表达的蛋白功能产生异常

综上所述

CHARGE综合征临床表现多样

涉及

多系统

CHARGE综合征可由

CHD7

SEMA3E

基因

变异导致

其中

CHD7

基因突变是导致

CHARGE

综合

征的主要原因

本组例1患儿

CHD7

位点突变导致编

码的

CHD7

蛋白截短

例2患儿

CHD7

位点变异除本

身可能导致错义突变致病外

也可能由于变异位点导

TGCATT

致SRp55蛋白结合的ESE位点消失

影响

pre-mRNA剪接准确率

进而影响CHD7蛋白功能

参考文献:

[1]

[2]

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ejhg.2015.15.

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[8]

[7]

[6]

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mRNA splicing [J]. Annu Rev Biochem, 2015, 84: 291-323.

(收稿日期:2019-04-26)

蔡虹蔚

)(本文编辑:

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