2024年4月11日发(作者:)
外泌体分离提纯草案
By 朱旭峰
一、 以超高速离心的方法来分离外泌体(细胞上清)
1:1.000的蛋白酶抑制剂混合。(sigma)
1.1 细胞培养液(CM)是来自无菌的80%-90%的培植细胞,并用浓度比
1.2 快速地将CM用0.22μm 的过滤筛(Millipore)过滤,来分离完整地
细胞和残渣。超速离心于120,000_g (Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor
A-641) 4 ℃ . 2 小时
1.3 用1mL 冷的 PBS 重悬和清洗 小囊泡 ,再次超速离心 120,000_g
(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor A-641) 4 ℃ . 2 小时
1.4 再用100μL 冷的 PBS 重悬后转移到 低粘附的管中
1.5 快速地使用或置于-80℃中待用为检测外泌体的蛋白浓度,取2μL
的样品置于卡上,用Direct Detect™(Millipore)
2 材料
a)
b)
c)
d)
e)
f)
二、
细胞培养液
蛋白酶抑制(Sigma)
过滤筛(Millipore)
冷的 PBS
低粘附的管
Direct Detect™(Millipore)
以超高速离心的方法来分离外泌体(人血浆)
(Sigma)
1.2 将上清液移至一个新的管中离心200*g 20分钟 4℃
1.3 小心地再将上清液移至新的管中 离心 10000*g 30分钟于4℃ 来
去除较大的囊泡、
1.4 此阶段的样品可以
1.5 将样品用0.22μm的注射器滤筛(Millipore)过滤并且离心110000g
(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor F65L) 2小时 4℃
1.6 用冷的PBS重悬后再次超速离心(110,000g, 1 h, 4 ℃).,
1.7 将外泌体小心干燥并且用冷的PBS重悬
1.8 外泌体应该立即使用或-80摄氏度冷藏
2. 材料
1.1 在提取外泌体之前应该向血浆里添加1;500浓度比的蛋白酶抑制剂
a) 蛋白酶抑制(Sigma)
b) 过滤筛(Millipore)
c) 冷的 PBS
d) 低粘附的管
e) Direct Detect™(Millipore)
三、 ExoQuick
TM
化学沉淀法
1.1 ExoQuick
TM
的使用要按照厂家提供的说明书来实行
1.2 该试剂盒可以简单地提取CM,人血浆,和血清里的外泌体,只需用
倒相管
按照所指示的量来加入ExoQuick
TM
试剂盒里的溶液
1.3 溶液孵化过夜,在4℃ 温和的摇晃
1.4 在流式细胞仪缓冲液中洗涤
1.5 试剂盒里的带荧光的免疫磁珠已经被绑定,用流式细胞仪鉴定即可
(BD Biosciences) 配合使用CellQuest 的软件。
2 材料
a) ExoQuick
TM
试剂盒
b) 流式细胞仪
四、 用ME
TM
分离外泌体
NEP)稀释
1.2 样品要事先处理好,17,000g 7分钟 来去除微粒物质
1.3 然后用ME
TM
试剂来孵化样品(NEP peptide)并且用旋转震荡在室温
混合15分钟
1.4 孵化完的样品要室温离心10000g 7分钟
1.5 所有的样品要用PBS洗三次
1.6 最后小囊泡要用合适的KIT缓冲液重悬
五、 抗体
以下的外泌体有关的一抗和二抗是用作:Westen Blot,ELISA和FACS(流
式细胞术)
1.1 mAb aCD9, mAb aCD63, mAb aCD81, mAb aCD63-FITC, aCD81-PE, 来
自于 Beckton Dickinson,
1.2 mAb aCD63-biotin (BioLegend),
1.3 mAb aAlix (Santa Cruz),
1.4 mAb aTsg101 (Abcam),
1.5 pAb aRab5 (Santa Cruz),
1.6 mrAb aRab5 (Epitomics),
1.1 样品(CM或人血清)要按照商品说明书(New England Peptide –
1.7 mAb aCalnexin (Abcam),
1.8 二抗是 anti-Mouse和 anti-Rabbit HRP-conjugated (Dako). 专门的
肿瘤外泌体 (HBM1 and HBM2) 结合抗体 由 HansaBioMed R&D
team.提供
六、 用Westen Blot 探测外泌体的蛋白
下
1.2 用SDS-page分离外泌体的蛋白质
1.3 把蛋白转到硝酸纤维素膜上(GE Healthcare)
1.4 一二抗体孵化
1.5 信号要在暗室里用ECL附加
七、 外泌体免疫捕捉和蛋白定量 ELISA
免疫捕捉 而筛选外泌体结合抗体(96孔板的抗体用碳酸氢盐缓冲
液PH=9.6稀释,用0.5%BSA固定和1%的蔗糖稳定)
1.2 PBS加入0.05% Tween-20(PBST)作为洗涤缓冲液,但如果有提示
说明,应该用PBS稀释样品
1.3 将外泌体样本,CM,人血浆样本加入96板孔内(最终容积为100
μl),孵化4℃过夜或者 室温2小时(可以使用商业化的exosomes
捕捉平板(HansaBioMed))
1.4 传统上的protocol包含使用主要的抗体(aCD9或aCD63)在样品缓
冲液(0.5%BSA PBS)中稀释2小时于4℃。
1.5 在大量的冲洗后,用辣根过氧化物酶二抗(BioRad),在需要的地方
用样品缓冲液1小时于4℃。
基于BM Blue POD Substrate辣根过氧化物酶的底物 (Roche)反应的
光密度反应,在450nm的酶标仪下记录Infinite_M1000 (TECAN)
a) QuantaBlu Fluorogenic Peroxidase Substrate(Thermo Scientific)要用连
续的激发 光束在325/425nm
b) SuperSignal West Femto Chemiluminescent Substrate (Thermo
Scientific)要先孵 化1分钟然后在酶标仪化学发光模式读数
2. 材料
a) 96孔板
b) 碳酸氢盐缓冲液PH=9.6
c) BSA PBS Tween-20 蔗糖
d) 辣根过氧化物酶二抗
1.1 从已经加了不同抗体的96孔板(Nunc)里的细胞上清或者人血浆 为
1.1 将样品用合适容积的蛋白loading Buffer(Lonza)重悬在合适的浓度
e) 辣根过氧化物酶的底物
f) 酶标仪
八、 磁珠捕获外泌体
1. 商业化的预包裹的乳胶微球
1.1 根据商品说明书(HansaBioMed)来分离外泌体
1.2 每个样品先用1ml的PBS来稀释
1.3 选用合适的珠子去孵化4℃过夜,旋转震荡。
1.4 之后可以用离心的方法来分离(5000个,10分钟),再用PBST洗涤3
次。
2. 磁珠分离法
2.1 比较了“1μm大小的链霉亲和素磁珠” (Thermo Scientific, 88816)
和“亚显微大小的超磁力珠”(内部订购)
2.2 先用PBST洗涤磁珠然后加入1.2μg的抗体(外泌体结合的同种抗体,
CD9抗体(Beckton Dickinson))
2.3 生物素化的抗体用于链霉亲和素磁珠,然后用PBST洗三次,再用合
适的固定剂固定(干酪素,BSA或人血清)室温1小时
2.4 重悬于PBS,然后加入样品(CM或人血浆)
2.5 为了最终可以富集磁珠到近10
8
/ml,将其孵化过夜4摄氏度旋转
rotation
2.6 用电磁分离磁珠,在量化外泌体蛋白或提取外泌体RNA之前用PBST
洗三次
2.7 磁珠也会溶解于Laemmli buffer,所以在做为westen bolt先将其煮沸
或者可以选择做bead-based ELISA
3. 免疫珠分离法
3.1 用主要的抗体孵化免疫磁珠2小时于室温,用ELISA缓冲液冲洗
3.2 再加入二抗(辣根过氧化物酶)孵化1小时,然后大量的冲洗之
3.3 为了可以被侦测到,需加入底物BM Blue POD Substrate (Roche),孵
化10分钟为了终止反应,加入硫酸,并在450nm波长下读数
4. 材料
a) 商品化的磁珠
b) 辣根过氧化物酶二抗
c) 辣根过氧化物酶的底物
d) 酶标仪
e) PBST
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