exosomes外泌体实验方案

exosomes外泌体实验方案


2024年4月11日发(作者:)

外泌体分离提纯草案

By 朱旭峰

一、 以超高速离心的方法来分离外泌体(细胞上清)

1:1.000的蛋白酶抑制剂混合。(sigma)

1.1 细胞培养液(CM)是来自无菌的80%-90%的培植细胞,并用浓度比

1.2 快速地将CM用0.22μm 的过滤筛(Millipore)过滤,来分离完整地

细胞和残渣。超速离心于120,000_g (Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor

A-641) 4 ℃ . 2 小时

1.3 用1mL 冷的 PBS 重悬和清洗 小囊泡 ,再次超速离心 120,000_g

(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor A-641) 4 ℃ . 2 小时

1.4 再用100μL 冷的 PBS 重悬后转移到 低粘附的管中

1.5 快速地使用或置于-80℃中待用为检测外泌体的蛋白浓度,取2μL

的样品置于卡上,用Direct Detect™(Millipore)

2 材料

a)

b)

c)

d)

e)

f)

二、

细胞培养液

蛋白酶抑制(Sigma)

过滤筛(Millipore)

冷的 PBS

低粘附的管

Direct Detect™(Millipore)

以超高速离心的方法来分离外泌体(人血浆)

(Sigma)

1.2 将上清液移至一个新的管中离心200*g 20分钟 4℃

1.3 小心地再将上清液移至新的管中 离心 10000*g 30分钟于4℃ 来

去除较大的囊泡、

1.4 此阶段的样品可以

1.5 将样品用0.22μm的注射器滤筛(Millipore)过滤并且离心110000g

(Sorvall WX ULTRA SERIES, rotor F65L) 2小时 4℃

1.6 用冷的PBS重悬后再次超速离心(110,000g, 1 h, 4 ℃).,

1.7 将外泌体小心干燥并且用冷的PBS重悬

1.8 外泌体应该立即使用或-80摄氏度冷藏

2. 材料

1.1 在提取外泌体之前应该向血浆里添加1;500浓度比的蛋白酶抑制剂

a) 蛋白酶抑制(Sigma)

b) 过滤筛(Millipore)

c) 冷的 PBS

d) 低粘附的管

e) Direct Detect™(Millipore)

三、 ExoQuick

TM

化学沉淀法

1.1 ExoQuick

TM

的使用要按照厂家提供的说明书来实行

1.2 该试剂盒可以简单地提取CM,人血浆,和血清里的外泌体,只需用

倒相管

按照所指示的量来加入ExoQuick

TM

试剂盒里的溶液

1.3 溶液孵化过夜,在4℃ 温和的摇晃

1.4 在流式细胞仪缓冲液中洗涤

1.5 试剂盒里的带荧光的免疫磁珠已经被绑定,用流式细胞仪鉴定即可

(BD Biosciences) 配合使用CellQuest 的软件。

2 材料

a) ExoQuick

TM

试剂盒

b) 流式细胞仪

四、 用ME

TM

分离外泌体

NEP)稀释

1.2 样品要事先处理好,17,000g 7分钟 来去除微粒物质

1.3 然后用ME

TM

试剂来孵化样品(NEP peptide)并且用旋转震荡在室温

混合15分钟

1.4 孵化完的样品要室温离心10000g 7分钟

1.5 所有的样品要用PBS洗三次

1.6 最后小囊泡要用合适的KIT缓冲液重悬

五、 抗体

以下的外泌体有关的一抗和二抗是用作:Westen Blot,ELISA和FACS(流

式细胞术)

1.1 mAb aCD9, mAb aCD63, mAb aCD81, mAb aCD63-FITC, aCD81-PE, 来

自于 Beckton Dickinson,

1.2 mAb aCD63-biotin (BioLegend),

1.3 mAb aAlix (Santa Cruz),

1.4 mAb aTsg101 (Abcam),

1.5 pAb aRab5 (Santa Cruz),

1.6 mrAb aRab5 (Epitomics),

1.1 样品(CM或人血清)要按照商品说明书(New England Peptide –

1.7 mAb aCalnexin (Abcam),

1.8 二抗是 anti-Mouse和 anti-Rabbit HRP-conjugated (Dako). 专门的

肿瘤外泌体 (HBM1 and HBM2) 结合抗体 由 HansaBioMed R&D

team.提供

六、 用Westen Blot 探测外泌体的蛋白

1.2 用SDS-page分离外泌体的蛋白质

1.3 把蛋白转到硝酸纤维素膜上(GE Healthcare)

1.4 一二抗体孵化

1.5 信号要在暗室里用ECL附加

七、 外泌体免疫捕捉和蛋白定量 ELISA

免疫捕捉 而筛选外泌体结合抗体(96孔板的抗体用碳酸氢盐缓冲

液PH=9.6稀释,用0.5%BSA固定和1%的蔗糖稳定)

1.2 PBS加入0.05% Tween-20(PBST)作为洗涤缓冲液,但如果有提示

说明,应该用PBS稀释样品

1.3 将外泌体样本,CM,人血浆样本加入96板孔内(最终容积为100

μl),孵化4℃过夜或者 室温2小时(可以使用商业化的exosomes

捕捉平板(HansaBioMed))

1.4 传统上的protocol包含使用主要的抗体(aCD9或aCD63)在样品缓

冲液(0.5%BSA PBS)中稀释2小时于4℃。

1.5 在大量的冲洗后,用辣根过氧化物酶二抗(BioRad),在需要的地方

用样品缓冲液1小时于4℃。

基于BM Blue POD Substrate辣根过氧化物酶的底物 (Roche)反应的

光密度反应,在450nm的酶标仪下记录Infinite_M1000 (TECAN)

a) QuantaBlu Fluorogenic Peroxidase Substrate(Thermo Scientific)要用连

续的激发 光束在325/425nm

b) SuperSignal West Femto Chemiluminescent Substrate (Thermo

Scientific)要先孵 化1分钟然后在酶标仪化学发光模式读数

2. 材料

a) 96孔板

b) 碳酸氢盐缓冲液PH=9.6

c) BSA PBS Tween-20 蔗糖

d) 辣根过氧化物酶二抗

1.1 从已经加了不同抗体的96孔板(Nunc)里的细胞上清或者人血浆 为

1.1 将样品用合适容积的蛋白loading Buffer(Lonza)重悬在合适的浓度

e) 辣根过氧化物酶的底物

f) 酶标仪

八、 磁珠捕获外泌体

1. 商业化的预包裹的乳胶微球

1.1 根据商品说明书(HansaBioMed)来分离外泌体

1.2 每个样品先用1ml的PBS来稀释

1.3 选用合适的珠子去孵化4℃过夜,旋转震荡。

1.4 之后可以用离心的方法来分离(5000个,10分钟),再用PBST洗涤3

次。

2. 磁珠分离法

2.1 比较了“1μm大小的链霉亲和素磁珠” (Thermo Scientific, 88816)

和“亚显微大小的超磁力珠”(内部订购)

2.2 先用PBST洗涤磁珠然后加入1.2μg的抗体(外泌体结合的同种抗体,

CD9抗体(Beckton Dickinson))

2.3 生物素化的抗体用于链霉亲和素磁珠,然后用PBST洗三次,再用合

适的固定剂固定(干酪素,BSA或人血清)室温1小时

2.4 重悬于PBS,然后加入样品(CM或人血浆)

2.5 为了最终可以富集磁珠到近10

8

/ml,将其孵化过夜4摄氏度旋转

rotation

2.6 用电磁分离磁珠,在量化外泌体蛋白或提取外泌体RNA之前用PBST

洗三次

2.7 磁珠也会溶解于Laemmli buffer,所以在做为westen bolt先将其煮沸

或者可以选择做bead-based ELISA

3. 免疫珠分离法

3.1 用主要的抗体孵化免疫磁珠2小时于室温,用ELISA缓冲液冲洗

3.2 再加入二抗(辣根过氧化物酶)孵化1小时,然后大量的冲洗之

3.3 为了可以被侦测到,需加入底物BM Blue POD Substrate (Roche),孵

化10分钟为了终止反应,加入硫酸,并在450nm波长下读数

4. 材料

a) 商品化的磁珠

b) 辣根过氧化物酶二抗

c) 辣根过氧化物酶的底物

d) 酶标仪

e) PBST


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