药物筛选简要流程

药物筛选简要流程


2024年4月11日发(作者:)

药物筛选流程

一、概述

1. 细胞层面的筛选

Cell culture (96-well plate)

Compounds (depend on kinases)+6 repeats

Cell culture

Detecting regents,

Microplate reader (OD)

IC50/EC50 caculation

Two times of repeating assay

2. 酶层面筛选

Kinase Assay

Biotin-Substrate (For example) Cell culture

96-well plate coated with

streptavidin

(For example) Compounds +3 repeats

Compounds (depend on kinases)+ 3 repeats Incubated

Kinase and other regents Protein preparation

Incubated Substrates and detecting regents

Microplate reader (Fluorescence, luminescence, OD,)

IC50/EC50 caculation

Two times of repeating assay

二、

药物筛选流程示例

ELISA检测NRG突变体的活性

目的:

通过检测NRG突变体刺激ErbB2/ErbB3 及ErbB2/ErbB4表达细胞的酪氨酸磷酸

化,评价其生物活性。

原理:

KIRA(kinase receptor activation)是一种新型的生物测定方法,它通过测定配

基诱导的受体酪氨酸激酶磷酸化形式的活化,能够快速、准确、灵敏地定量测定

配基的生物活性。

HER2/neu基因编码具有酪氨酸蛋白激酶活性的跨膜蛋白p185,常与ErbB3

或ErbB4形成异源二聚体,通过ErbB3或ErbB4与相应配体Neuregulin-1的结

合,激活HER2编码的酪氨酸蛋白激酶,使其相应位点磷酸化。利用NRG-1能

与细胞表面ErbB3/ErbB4分子结合、介导ErbB2蛋白磷酸化的这一特性,可用

KIRA-ELISA法测定rhNRG-1及其突变体蛋白的体外生物学活性。

材料:

1、96孔细胞培养板(BD FALCON

®

);Nunc MaxiSorp 酶标检测板。

2、IMDM培养基,透析胎牛血清(PAA),G418,MTX,胰酶,PBS等。

3、鼠抗人ErbB2单克隆抗体H4,公司自制。

4、辣根过氧化物酶(HRP)标记的鼠抗人磷酸化酪氨酸蛋白单抗

p-Tyr(PY99):Sc-7020 HRP(Santa Cruz Biotechnology)。

5、细胞裂解液:150mM NaCl+50mM Hepes+1%Triton-X 100+2 mM钒酸钠

(sodium orthovanadate)+0.01%硫柳汞(thimerosol)。临用前每25ml加入一片

混合蛋白酶抑制剂(Protease-inhibitor-cocktail Tablet,Roche)。

6、TMB显色系统(TMB、底物缓冲液、终止液2N H

2

SO

4

)。

7、稳定转染2, 4-CHO细胞;瞬时转染2,3-COS-7细胞。

技术路线:

细胞培养→NRG刺激→细胞裂解→裂解液中p-Tyr ELISA检测

方法:

一、标准程序:

1、接种细胞。96孔细胞培养板,2,4-CHO细胞每孔接种5~6×10

4

个细胞,37℃,

5% CO

2

培养箱培养24hr。

COS-7每孔接种3×10

4

个细胞,次日做瞬时转染,作为2,3-COS-7细胞,转

染24h后饥饿。

2、细胞饥饿。吸净96孔板中的培养基,用37℃温育后的PBS清洗细胞,然后

加入100 μl IMDM基础培养基(不含附加成分),置37℃,5%CO

2

培养箱培养

24hr以上。

对COS-7细胞,则先对细胞进行ErbB2/ErbB3质粒共转染。24h后再进行细

胞饥饿操作。

3、包被酶标板。用包被缓冲液稀释抗ErbB2抗体至8 μg/ml,以70 μl /孔加至96

孔酶标板内,置4℃过夜(16~18hr)。

4、封闭酶标板。洗板5次。用洗涤液配5%脱脂奶粉,以200 μl/孔加至板内,

置37℃ 2hr。洗板5次,待用。

5、配制标准品和样品溶液。在一块96孔微孔板中,将标准品及待测样品用

IMDM基础培养基稀释至2 μg/ml,再依次作3倍梯度稀释,共做7个稀释度。

每个稀释度做4个复孔。

6、刺激细胞磷酸化。将饥饿后的96孔细胞培养板中培养基吸净,与96孔微孔

板相对应,分别加入标准品和测试样品溶液,100μl /孔,同时设置阴性对照(即

IMDM培养基空白对照)。37℃,5%CO

2

培养箱作用20min。

7、细胞裂解。迅速吸去刺激溶液并用PBS洗涤一遍,然后加入100 μl细胞裂解

液,置4℃冰箱,微量振荡器上振荡裂解30min使细胞完全脱落。4℃,3000rpm

离心15min。

8、加样。将标准和待检样品对应的细胞裂解液均以90 μl/孔加至封闭好的酶标板

内,置37℃1hr。

9、加酶标抗体。洗板5次。用洗液1:600稀释p-Tyr-HRP抗体,以100 μl/孔加

至酶标板内,37℃ 孵育1hr。

10、底物显色。洗板5次。以100 μl/孔加入新鲜配制的底物工作液,37℃显色

10min左右(需根据颜色深浅适当调整)。

11、终止。以50 μl/孔加入2N H

2

SO

4

,终止显色。

12、测定O.D.450。将板放入酶标仪中,选择测定波长450nm,参比波长655nm

测O.D.值,记录测定结果。

样品制备及步骤:

(1) 标定NRG对照、突变体蛋白47R与47K的蛋白浓度;

(2) 按所标定的浓度验证47R与47K的生物活性:

a. 用2, 4-CHO细胞验证47R与47K的活性,同时用瞬时转染的方法获得

2, 4-COS7细胞,测定47R与47K对2, 4-COS7细胞的生物活性,比较这

两种细胞体系测定结果是否一致;

b. 验证47R与47K 对2, 3-COS7细胞的活性。

Ⅱ 细胞接种:

(1) COS-7细胞接种:消化一瓶COS-7细胞,计数后按3×10

4

/孔接种于96孔

板,共接种4块培养板,其中2块用于转染ErbB2/ErbB3,另2块用于转

染ErbB2/ErbB4。剩余细胞继续培养保种。

(2) 2, 4-CHO细胞接种:消化2瓶2, 4-CHO细胞,计数为1.65×10

7

个,调整

密度按5×10

4

/孔接种于96孔板,共接种2块培养板,分别用于测定47R

与47K的生物活性。剩余细胞继续培养。

Ⅲ BCA测定结果:

标准曲线:

BSA标准曲线(08-3-10)

2.500

2.000

y = 0.0009x + 0.166

R

2

= 0.999

O

.

D

.

5

6

2

1.500

1.000

0.500

0.000

BSA浓度(μg/ml)

20002500

080311:

Ⅰ 2, 4-CHO细胞饥饿;

Ⅱ COS-7细胞转染:

(1) ErbB2/ErbB3共转染:ErbB2质粒浓度549 μg/ml,ErbB3质粒浓度450

μg/ml。转染体系为:每块板50 μlT-gene转染试剂+1 mlDMEM+DNA各

20 μg。转染过程为:

a) 将转染试剂T-gene加入无血清DMEM培养基,混匀后放置2-3min;

b) 将质粒DNA缓缓加入T-gene/DMEM复合物,混匀室温放置30min;

c) 将以上混合物平均分配到细胞培养孔,轻摇混匀,细胞放入培养箱继续培

养。

(2) ErbB2/ErbB4共转染:ErbB2质粒浓度549 μg/ml,ErbB4质粒浓度285

μg/ml。按1:1比例共转染。转染过程与ErbB2/ErbB3相同。

Ⅲ 实验孔设计

2,4-CHO细胞,2,3-COS-7及2,4-COS-7均按下表安排进行实验,其中,2,4-CHO

细胞于12日进行刺激,瞬转细胞于13日进行刺激:

080312:

Ⅰ 2,3-COS-7及2,4-COS-7细胞饥饿。

由于细胞密度高,在加入PBS洗细胞后有较多细胞脱落,有的孔细胞脱落比较

严重,可能会影响实验结果。

Ⅱ KIRA-ELISA测定NRG、47R及47K对 2,4-CHO细胞的生物活性。

a. 蛋白溶液配制。

1)先按工作液配制表将蛋白统一配制为浓度250μg/ml的工作液;

2)如表2所示方法稀释蛋白。取两块国产酶标板,用排枪按列分别加入相应体

积的IMDM基础培养基,然后向第1列加入50μl的工作液,则第1列即得

到5倍稀释,浓度为50μg/ml。吹打均匀后,自第1列取出50μl液体加到第

2列,换枪头,将第2列吹打均匀,取出50μl加到第3列。如此依次稀释,

即可将蛋白稀释到表2最后一行所示的终浓度。

表1:工作液配制表

工作液浓度

蛋白名称

原液浓度(μg/ml)

1ml工作液所需原液

(μl)

补加IMDM(μl)

0.5ml工作液所需原液

(μl)

补加IMDM(μl)

表2:蛋白稀释方法

A

B 200μl

1 2

20

0

20

0

20

0

20

0

20

3

20

0

20

0

20

0

20

0

20

140

4

140

5

140

6

140

7

140

8

140

9 10

140

11

14

0

14

0

14

0

14

0

14

250μg/m

l

NRG

1578.89

158.3

841.7

79.2

420.8

47R

1854.44

134.8

865.2

67.4

432.6

47K

3374.44

74.1

925.9

37.0

463.0

C 200μl 140 140 140 140 140 140 140

D 200μl 140 140 140 140 140 140 140

E

F

200μl

200μl

140

140

140

140

140

140

140

140

140

140

140

140

140

140

0

G 200μl

20

0

+5

0

10

0

20

0

+5

0

2

140

+70

0.6666

7

140

+70

0.2222

2

140

+70

0.0740

7

140

+70

0.0246

9

140

+70

0.0082

3

140

+70

0.0027

4

140

+70

0.0009

1

0

14

0

0

H

+50μl

终浓

50μg/m

l

0

b.刺激细胞磷酸化。

去掉培养孔中的培养液,将配制好的蛋白溶液按列对应加到细胞培养板中。37℃

作用20min。

c. 细胞裂解。

弃去蛋白溶液,每孔加入100μl冷的PBS洗细胞一次。然后加入100μl细胞裂解

液,4℃振荡裂解30min。然后4℃,3000rpm离心15min。

d.ELISA测定。

用排枪自每孔取出90μl细胞裂解液,对应加到酶标板中,37℃孵育1h。洗板后

加p-Tyr-HRP抗体,37℃孵育1h。洗板,TMB显色,2N H

2

SO

4

终止后测定450nm

处的吸光值。

测定结果分析:

S型剂量效应曲线:

结果分析:

此次测定整体吸光值偏小,最高只有0.3左右,因此很不理想。以往同等条件下

最高吸光值一般在0.8左右。可能的原因有:(1)细胞。重新复苏的细胞受体表

达水平可能有变化,如果受体较少则磷酸化信号不强;(2)ELISA过程中的因素,

尤其是显色系统。这其中牵涉到因素较多,但可以通过设立阳性对照来鉴别。由

于MCF-7细胞的磷酸化反应是相对稳定的,可以接入一列MCF-7细胞来作为整

个过程的阳性对照。

从结果来看,47R及47K的效价相对NRG有所提高。

Ⅰ KIRA-ELISA测定NRG、47R及47K对 2,4-COS-7及2,3-COS-7细胞的生物

活性。

a. 蛋白溶液配制。

1)配制浓度为250μg/ml的工作液;

2)将工作液梯度稀释到所需的各个浓度。

b.刺激细胞磷酸化。

去掉培养孔中的培养液,将配制好的蛋白溶液对应加到细胞培养板中。37℃作用

20min。2,4-COS-7细胞与2,3-COS-7细胞间隔30min以上进行,错开操作以充分

利用时间并避免冲突。

c. 细胞裂解。

弃去蛋白溶液,每孔加入100μl冷的PBS洗细胞一次。然后加入100μl细胞裂解

液,4℃振荡裂解30min。然后4℃,3000rpm离心15min。

d.ELISA测定。

用排枪自每孔取出90μl细胞裂解液,对应加到酶标板中,37℃孵育1h。洗板后

加p-Tyr-HRP抗体,37℃孵育1h。洗板,TMB显色,2N H

2

SO

4

终止后测定450nm

处的吸光值。


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