2024年4月11日发(作者:)
药物筛选流程
一、概述
1. 细胞层面的筛选
Cell culture (96-well plate)
Compounds (depend on kinases)+6 repeats
Cell culture
Detecting regents,
Microplate reader (OD)
IC50/EC50 caculation
Two times of repeating assay
2. 酶层面筛选
Kinase Assay
Biotin-Substrate (For example) Cell culture
96-well plate coated with
streptavidin
(For example) Compounds +3 repeats
Compounds (depend on kinases)+ 3 repeats Incubated
Kinase and other regents Protein preparation
Incubated Substrates and detecting regents
Microplate reader (Fluorescence, luminescence, OD,)
IC50/EC50 caculation
Two times of repeating assay
二、
药物筛选流程示例
ELISA检测NRG突变体的活性
目的:
通过检测NRG突变体刺激ErbB2/ErbB3 及ErbB2/ErbB4表达细胞的酪氨酸磷酸
化,评价其生物活性。
原理:
KIRA(kinase receptor activation)是一种新型的生物测定方法,它通过测定配
基诱导的受体酪氨酸激酶磷酸化形式的活化,能够快速、准确、灵敏地定量测定
配基的生物活性。
HER2/neu基因编码具有酪氨酸蛋白激酶活性的跨膜蛋白p185,常与ErbB3
或ErbB4形成异源二聚体,通过ErbB3或ErbB4与相应配体Neuregulin-1的结
合,激活HER2编码的酪氨酸蛋白激酶,使其相应位点磷酸化。利用NRG-1能
与细胞表面ErbB3/ErbB4分子结合、介导ErbB2蛋白磷酸化的这一特性,可用
KIRA-ELISA法测定rhNRG-1及其突变体蛋白的体外生物学活性。
材料:
1、96孔细胞培养板(BD FALCON
®
);Nunc MaxiSorp 酶标检测板。
2、IMDM培养基,透析胎牛血清(PAA),G418,MTX,胰酶,PBS等。
3、鼠抗人ErbB2单克隆抗体H4,公司自制。
4、辣根过氧化物酶(HRP)标记的鼠抗人磷酸化酪氨酸蛋白单抗
p-Tyr(PY99):Sc-7020 HRP(Santa Cruz Biotechnology)。
5、细胞裂解液:150mM NaCl+50mM Hepes+1%Triton-X 100+2 mM钒酸钠
(sodium orthovanadate)+0.01%硫柳汞(thimerosol)。临用前每25ml加入一片
混合蛋白酶抑制剂(Protease-inhibitor-cocktail Tablet,Roche)。
6、TMB显色系统(TMB、底物缓冲液、终止液2N H
2
SO
4
)。
7、稳定转染2, 4-CHO细胞;瞬时转染2,3-COS-7细胞。
技术路线:
细胞培养→NRG刺激→细胞裂解→裂解液中p-Tyr ELISA检测
方法:
一、标准程序:
1、接种细胞。96孔细胞培养板,2,4-CHO细胞每孔接种5~6×10
4
个细胞,37℃,
5% CO
2
培养箱培养24hr。
COS-7每孔接种3×10
4
个细胞,次日做瞬时转染,作为2,3-COS-7细胞,转
染24h后饥饿。
2、细胞饥饿。吸净96孔板中的培养基,用37℃温育后的PBS清洗细胞,然后
加入100 μl IMDM基础培养基(不含附加成分),置37℃,5%CO
2
培养箱培养
24hr以上。
对COS-7细胞,则先对细胞进行ErbB2/ErbB3质粒共转染。24h后再进行细
胞饥饿操作。
3、包被酶标板。用包被缓冲液稀释抗ErbB2抗体至8 μg/ml,以70 μl /孔加至96
孔酶标板内,置4℃过夜(16~18hr)。
4、封闭酶标板。洗板5次。用洗涤液配5%脱脂奶粉,以200 μl/孔加至板内,
置37℃ 2hr。洗板5次,待用。
5、配制标准品和样品溶液。在一块96孔微孔板中,将标准品及待测样品用
IMDM基础培养基稀释至2 μg/ml,再依次作3倍梯度稀释,共做7个稀释度。
每个稀释度做4个复孔。
6、刺激细胞磷酸化。将饥饿后的96孔细胞培养板中培养基吸净,与96孔微孔
板相对应,分别加入标准品和测试样品溶液,100μl /孔,同时设置阴性对照(即
IMDM培养基空白对照)。37℃,5%CO
2
培养箱作用20min。
7、细胞裂解。迅速吸去刺激溶液并用PBS洗涤一遍,然后加入100 μl细胞裂解
液,置4℃冰箱,微量振荡器上振荡裂解30min使细胞完全脱落。4℃,3000rpm
离心15min。
8、加样。将标准和待检样品对应的细胞裂解液均以90 μl/孔加至封闭好的酶标板
内,置37℃1hr。
9、加酶标抗体。洗板5次。用洗液1:600稀释p-Tyr-HRP抗体,以100 μl/孔加
至酶标板内,37℃ 孵育1hr。
10、底物显色。洗板5次。以100 μl/孔加入新鲜配制的底物工作液,37℃显色
10min左右(需根据颜色深浅适当调整)。
11、终止。以50 μl/孔加入2N H
2
SO
4
,终止显色。
12、测定O.D.450。将板放入酶标仪中,选择测定波长450nm,参比波长655nm
测O.D.值,记录测定结果。
样品制备及步骤:
(1) 标定NRG对照、突变体蛋白47R与47K的蛋白浓度;
(2) 按所标定的浓度验证47R与47K的生物活性:
a. 用2, 4-CHO细胞验证47R与47K的活性,同时用瞬时转染的方法获得
2, 4-COS7细胞,测定47R与47K对2, 4-COS7细胞的生物活性,比较这
两种细胞体系测定结果是否一致;
b. 验证47R与47K 对2, 3-COS7细胞的活性。
Ⅱ 细胞接种:
(1) COS-7细胞接种:消化一瓶COS-7细胞,计数后按3×10
4
/孔接种于96孔
板,共接种4块培养板,其中2块用于转染ErbB2/ErbB3,另2块用于转
染ErbB2/ErbB4。剩余细胞继续培养保种。
(2) 2, 4-CHO细胞接种:消化2瓶2, 4-CHO细胞,计数为1.65×10
7
个,调整
密度按5×10
4
/孔接种于96孔板,共接种2块培养板,分别用于测定47R
与47K的生物活性。剩余细胞继续培养。
Ⅲ BCA测定结果:
标准曲线:
BSA标准曲线(08-3-10)
2.500
2.000
y = 0.0009x + 0.166
R
2
= 0.999
O
.
D
.
5
6
2
1.500
1.000
0.500
0.000
BSA浓度(μg/ml)
20002500
080311:
Ⅰ 2, 4-CHO细胞饥饿;
Ⅱ COS-7细胞转染:
(1) ErbB2/ErbB3共转染:ErbB2质粒浓度549 μg/ml,ErbB3质粒浓度450
μg/ml。转染体系为:每块板50 μlT-gene转染试剂+1 mlDMEM+DNA各
20 μg。转染过程为:
a) 将转染试剂T-gene加入无血清DMEM培养基,混匀后放置2-3min;
b) 将质粒DNA缓缓加入T-gene/DMEM复合物,混匀室温放置30min;
c) 将以上混合物平均分配到细胞培养孔,轻摇混匀,细胞放入培养箱继续培
养。
(2) ErbB2/ErbB4共转染:ErbB2质粒浓度549 μg/ml,ErbB4质粒浓度285
μg/ml。按1:1比例共转染。转染过程与ErbB2/ErbB3相同。
Ⅲ 实验孔设计
2,4-CHO细胞,2,3-COS-7及2,4-COS-7均按下表安排进行实验,其中,2,4-CHO
细胞于12日进行刺激,瞬转细胞于13日进行刺激:
080312:
Ⅰ 2,3-COS-7及2,4-COS-7细胞饥饿。
由于细胞密度高,在加入PBS洗细胞后有较多细胞脱落,有的孔细胞脱落比较
严重,可能会影响实验结果。
Ⅱ KIRA-ELISA测定NRG、47R及47K对 2,4-CHO细胞的生物活性。
a. 蛋白溶液配制。
1)先按工作液配制表将蛋白统一配制为浓度250μg/ml的工作液;
2)如表2所示方法稀释蛋白。取两块国产酶标板,用排枪按列分别加入相应体
积的IMDM基础培养基,然后向第1列加入50μl的工作液,则第1列即得
到5倍稀释,浓度为50μg/ml。吹打均匀后,自第1列取出50μl液体加到第
2列,换枪头,将第2列吹打均匀,取出50μl加到第3列。如此依次稀释,
即可将蛋白稀释到表2最后一行所示的终浓度。
表1:工作液配制表
工作液浓度
蛋白名称
原液浓度(μg/ml)
1ml工作液所需原液
(μl)
补加IMDM(μl)
0.5ml工作液所需原液
(μl)
补加IMDM(μl)
表2:蛋白稀释方法
A
B 200μl
1 2
20
0
20
0
20
0
20
0
20
3
20
0
20
0
20
0
20
0
20
140
4
140
5
140
6
140
7
140
8
140
9 10
140
11
14
0
14
0
14
0
14
0
14
250μg/m
l
NRG
1578.89
158.3
841.7
79.2
420.8
47R
1854.44
134.8
865.2
67.4
432.6
47K
3374.44
74.1
925.9
37.0
463.0
C 200μl 140 140 140 140 140 140 140
D 200μl 140 140 140 140 140 140 140
E
F
200μl
200μl
140
140
140
140
140
140
140
140
140
140
140
140
140
140
0
G 200μl
20
0
+5
0
10
0
20
0
+5
0
2
140
+70
0.6666
7
140
+70
0.2222
2
140
+70
0.0740
7
140
+70
0.0246
9
140
+70
0.0082
3
140
+70
0.0027
4
140
+70
0.0009
1
0
14
0
0
H
+50μl
终浓
50μg/m
度
l
0
b.刺激细胞磷酸化。
去掉培养孔中的培养液,将配制好的蛋白溶液按列对应加到细胞培养板中。37℃
作用20min。
c. 细胞裂解。
弃去蛋白溶液,每孔加入100μl冷的PBS洗细胞一次。然后加入100μl细胞裂解
液,4℃振荡裂解30min。然后4℃,3000rpm离心15min。
d.ELISA测定。
用排枪自每孔取出90μl细胞裂解液,对应加到酶标板中,37℃孵育1h。洗板后
加p-Tyr-HRP抗体,37℃孵育1h。洗板,TMB显色,2N H
2
SO
4
终止后测定450nm
处的吸光值。
测定结果分析:
略
S型剂量效应曲线:
略
结果分析:
此次测定整体吸光值偏小,最高只有0.3左右,因此很不理想。以往同等条件下
最高吸光值一般在0.8左右。可能的原因有:(1)细胞。重新复苏的细胞受体表
达水平可能有变化,如果受体较少则磷酸化信号不强;(2)ELISA过程中的因素,
尤其是显色系统。这其中牵涉到因素较多,但可以通过设立阳性对照来鉴别。由
于MCF-7细胞的磷酸化反应是相对稳定的,可以接入一列MCF-7细胞来作为整
个过程的阳性对照。
从结果来看,47R及47K的效价相对NRG有所提高。
Ⅰ KIRA-ELISA测定NRG、47R及47K对 2,4-COS-7及2,3-COS-7细胞的生物
活性。
a. 蛋白溶液配制。
1)配制浓度为250μg/ml的工作液;
2)将工作液梯度稀释到所需的各个浓度。
b.刺激细胞磷酸化。
去掉培养孔中的培养液,将配制好的蛋白溶液对应加到细胞培养板中。37℃作用
20min。2,4-COS-7细胞与2,3-COS-7细胞间隔30min以上进行,错开操作以充分
利用时间并避免冲突。
c. 细胞裂解。
弃去蛋白溶液,每孔加入100μl冷的PBS洗细胞一次。然后加入100μl细胞裂解
液,4℃振荡裂解30min。然后4℃,3000rpm离心15min。
d.ELISA测定。
用排枪自每孔取出90μl细胞裂解液,对应加到酶标板中,37℃孵育1h。洗板后
加p-Tyr-HRP抗体,37℃孵育1h。洗板,TMB显色,2N H
2
SO
4
终止后测定450nm
处的吸光值。
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