2024年7月4日发(作者：)
常用的生物数据库（二）
引言概述：生物数据库是生物信息学领域的重要工具，可以帮
助研究人员存储、管理和共享生物数据。本文将介绍常用的生物数
据库（二），以便研究人员更好地利用这些资源进行生物学研究。
正文内容：
一、蛋白质相互作用数据库
1. STRING数据库：提供蛋白质相互作用预测和注释功能。
2. IntAct数据库：收集整理蛋白质相互作用数据，提供数据检
索和分析工具。
3. BioGRID数据库：整合多种物种的蛋白质相互作用数据，并
提供丰富的功能注释。
二、基因组数据库
1. GenBank数据库：包含大量的序列数据，包括基因组、转录
本和蛋白质序列等。
2. ENSEMBL数据库：集成了各种生物信息学工具，提供全面的
基因组注释信息。
3. UCSC数据库：基于人类基因组构建的浏览器，提供详细的
基因组注释和可视化功能。
三、表达谱数据库
1. GEO数据库：收集了大量的基因表达谱数据，可进行数据检
索和分析。
2. ArrayExpress数据库：包含了来自各种高通量技术的表达谱
数据，提供数据下载和分析工具。
3. TCGA数据库：整合了多种癌症的基因表达数据，可进行差
异表达和生存分析等研究。
四、突变数据库
1. dbSNP数据库：记录了常见的单核苷酸多态性（SNP）数据，
是研究遗传变异的重要资源。
2. COSMIC数据库：专注于癌症相关的突变数据，包含了大量
的突变谱系和功能注释信息。
3. ClinVar数据库：整合了与人类疾病相关的遗传变异数据，提
供临床相关的注释信息。
五、药物数据库
1. DrugBank数据库：收录了大量的药物信息，包括结构、作
用机制和药理学数据等。
2. PubChem数据库：提供了大量的小分子化合物数据，可进行
化学结构搜索和药物筛选等研究。
3. ChEMBL数据库：整合了化合物活性数据和药物靶点信息，
可用于药物发现和优化。
总结：生物数据库为生物学研究提供了丰富的数据资源和分析
工具。蛋白质相互作用数据库、基因组数据库、表达谱数据库、突
变数据库和药物数据库是常用的生物数据库之一。通过合理利用这
些数据库，研究人员可以更加高效地进行生物学研究，推动科学的
进步。
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