2024年4月16日发(作者:)
南京农业大学学报
2021,44(1)
:
103-110
Journal
of
Nanjing
Agricultural
University
http
:
/
/
nauxb
.njau.
edu
.
cn
DO1
:
10.7685/jnau.202004037
李婷
,
朱文姣
,
陈敏
,
等
.
茄子
SmNTF3
基因的克隆及其表达模式分析
[J].
南京农业大学学报
,2021,44(1)
:
103-110.
L1
Ting
,ZHL
W'enjiao,CHEN
Min
,
et
al.
Cloning
and
expression
pattern
analysis
of
SmNTF3
gene
in
eggplant
[J].
Journal
of
Nanjing
Agricultural
Lniversity
,2021,44(1)
:
103-110.
茄子
SmNTF3
基因的克隆及其表达模式分析
李婷,朱文姣
,
陈敏
,
杨清
”
(
南京农业大学生命科学学院
,
江苏南京
210095)
摘要
:
[
目的
]
本文旨在克隆茄子
(
Solanum
melongena
L.)
促分裂原活化蛋白激酶
(
MAPK)
基因
SmNTF
3
,
阐明其在盐和干旱
胁迫处理下的表达特性
。
[
方法
]
以茄子
’
苏崎
1
号
’
为试验材料
,
克隆
SmNTF3
的全长序列
,
对其基因结构和序列同源性进
行分析
,
通过烟草叶片瞬时表达系统进行
SmNTF3
蛋白的亚细胞定位
,
采用实时荧光定量
PCR
检测
SmNTF3
基因在不同组
织及盐和干旱胁迫下的表达情况
。
[
结果
]
SmNTF3
基因开放阅读框长度为
1
119
bp
,
编码
1
个含
372
个氨基酸残基的蛋
白。
生物信息学分析表明
,
该蛋白具有保守的
S_TKc
结构域
,
富含
a
-
螺旋和无规则卷曲
。
系统发育分析表明
,
SmNTF3
属
于
MAPK
家族
C
组成员
,
其氨基酸序列具有高度保守性
,
与番茄和马铃薯亲缘关系最近
。
亚细胞定位发现
,SmNTF3
蛋白
在烟草叶片的细胞核和细胞质膜上表达
。
SmNTF3
基因具有组织特异性
,
在茎中表达量最高
。
盐和干旱胁迫能够显著诱导
SmNTF3
基因的上调表达
。
[
结论
]
从茄子中克隆了
1
个
MAPK
家族
C
组成员
SmNTF3
,
该基因受盐和干旱胁迫诱导表达
,
可能参与茄子对盐和干旱胁迫的响应过程
。
关键词
:
茄子
;
SmNTF3
基因
;
克隆
;
亚细胞定位
;
表达分析
中图分类号
:
S641.1
文献标志码
:
A
文章编号
:
1000-2030
(
2021
)
01-0103-08
Cloning
and
expression
pattern
analysis
of
SmNTF3
gene
in
eggplant
L1
Ting,ZHU
Wenjiao,CHEN
Min,YANG
Qing
*
(
College
of
Life
Sciences
,
Nanjing
Agricultural
University
,
Nanjing
210095,
China)
Abstract
:
[
Objectives
]
The
paper
aimed
to
clone
mitogen-activated protein
kinase
(
MAPK
)
gene
SmNTF3
in
eggplant
and
detect
its
expression
patterns
characteristics
under
salt
and
drought
stresses.
[
Methods
]
The
full-length
of
SmNTF3
was
cloned
from
eggplant
'
Suqi
1
The
gene
structure
and
sequence
homology
were
analyzed
by
bioinformatics
methods.
Subcellular
localization
of
SmNTF3
protein
was
performed
with
the
tobacco
leaf
transient
expression
system.
The
expression
patterns
of
SmNTF3
gene
in
different
organs
and
under
salt
and
drought
stresses
were
analyzed
using
real-time
quantitative
PCR
technique.
[
Results
]
The
open
reading
frame
of
the
eggplant
SmNTF3
gene
was
1
119
bp
in
length
,
and
encoded
a
protein
of
372
amino
acid
residues
with a
conserved
S_TKc
domain
and
the
rich
a
-helices
and
irregular
curls.
Phylogenetic
analysis
showed
that
SmNTF3
belonged
to
a
member
of
MAPK
fa^nily
,
and
the
amino
acid
sequence
of
SmNTF3
was
highly
conserved
and
had
the
closest
relationship
with tomato and
potato.
Subcellular
localization
analysis
revealed
that
SmNTF3
protein
was
located
on
the
nucleus
and
plasma
membrane
of
tobacco
leaves.
The
expression
level
of
SmNTF3
was
in
different
tissue-specific
and
high
in
stem
,
and
increased
under
the
salt
and
drought
treatments.
[
Conclusions
]
1n
this
study
,
SmNTF3
,
a
member
of
MAPK
family
C
,
was
cloned
from
eggplant
,
and
was
induced
by
salt
and
drought
stresses.
The
results
indicated
that
it
may
be
involved
in
the
response
of
eggplant
to
salt
and
drought
stresses.
Keywords
:
eggplant
;
SmNTF3
gene
;
cloning
;
subcellular
localization
;
expression
analysis
茄子
(
Solanum
melongena
L.
)
是世界范围内广泛种植的一种农作物
,
含多种维生素和生物碱
,
营养价
值丰富并兼具药用作用
。
我国茄子种质资源丰富
,
栽培普遍
,
但其产量和质量极易受各种不良环境的影
响
[
1
]
。
近年来
,
由于世界水资源的严重短缺以及保护地栽培造成的土壤盐碱化
,
干旱和盐胁迫已成为影
响农作物生长的重要胁迫源
[
2
]
。
因此
,
发掘抗旱
、
耐盐基因对于培育抗盐、
抗旱茄子品种具有重要意义
。
植物面对不利胁迫时会通过多种信号传导途径进行防卫
,
促分裂原活化蛋白激酶
(
MAPK)
级联途径
是真核生物主要存在的信号传导模块
[
3
]
。
在植物中
,
MAPK
通路由
MAPKKK(MAPKK
激酶
)
、
MAPKK
(
MAPK
激酶
)
和
MAPK
组成
,
通过磷酸传递机制将上游受体与下游靶点连接起来
,
参与生长发育
、
程序性
细胞死亡以及各种环境刺激的响应
[
4-5
]
o
已有相关研究报道
YODA
(a
MAPKKK
)
-
MKK4/MKK5-MPK3
/
收稿日期
:
2020-04-20
基金项目
:
国家自然科学基金项目
(
31901582)
;
江苏省自然科学基金项目
(
BK20180519)
;
江苏省高等学校优先级学术发展项目
一一
现代园
艺科学
(
PADH)
作者简介
:
李婷
,
硕士研究生
。
*
通信作者
:
杨清
,
教授
,
研究方向为植物分子与遗传工程
,
:
qyang19@
。
104
南
京
农
业
大
学
学
报第
44
卷
MPK6
能够有效调控花序结构
[
6
]
;
MKK9-MPK6
对叶片衰老过程有调节作用
[
7
]
;
GhMEKK14-GhMKK11-
GhMPK31
通路调节棉花的干旱胁迫耐受性等
[
8
]
。
MAPK
位于级联途径的下游
,
催化区域一般由
300
左右的氨基酸残基组成
,
该区域包含
11
个保守亚
结构域
(
I
—
卫
)
和
TXY
双磷酸化位点⑼
。
根据
TXY
基序
,
植物
MAPK
可被分为
4
组
(
A
—
D
)
,
不同的序
列结构参与多种生物学过程
。
研究表明机械损伤
、
干旱
、
低温
、
高盐及外源信号分子等胁迫都会诱导
MAPK
家族基因选择性表达
[
10-12]
;
转
MAPK
基因的植株能够显著增强环境抗逆性
[
13
]
,
表明该家族基因广
泛参与植物的胁迫响应过程
。
目前
,
MAPK
家族已在拟南芥
[
14
]
、
辣椒
[
15
]
、
棉花
[
16
]
、
水稻
[
17
]
等多种高等植物中被鉴定和研究
。
烟草
NTF3
基因已被报道在盐和干旱胁迫诱导下表达水平显著上调
[
18
]
,
但关于茄子
NTF3
基因的研究还未见
报道
。
本研究从茄子'苏崎
1
号
’
中克隆得到
SmNTF3
基因
,
对其系统发育关系
、
亚细胞定位及盐和干旱
胁迫下的表达模式进行分析
,
为进一步研究
SmNTF3
的生物学功能奠定基础
。
1
材料与方法
1.1
植物材料与处理
茄子
‘
苏崎
1
号
’
为江苏普遍种植品种
,
购于江苏省农业科学院
。
将种子
55
C
恒温水浴
15
min
以打
破休眠
,
消毒漂洗
,
平铺于
MS
培养基
,
置于光照
/
黑暗时间为
16
h/8
h
、
昼
/
夜温度为
(
28±1
)
C/
(
25±1
)
C
、
光照强度
200
jimol-m
_2
-s
_1
培养箱中培育
,
发芽后正常光照培养
。
待长出
4~5
片真叶
,
取出幼
苗水培
1
周
,
选取长势健康且一致的幼苗作为试验材料
。
每个试验重复
3
次
。
组织样品取样:取茄子
’
苏崎
1
号
’
植株的主根
、
茎段和幼嫩叶片迅速置于液氮中冷冻保存
,
用于
SmNTF3
基因组织表达模式检测
。
盐胁迫处理
:
将茄子幼苗浸泡在
0
、
50
、
100
、
150
、
200
和
250
mmol-L
-1
的
NaCl
培养液中
12
h,
取叶片进
行基因表达水平检测
;
选择响应最显著的
NaCl
浓度进行不同时间处理
,
分别于
0
、
3
、
6
、
12
、
24
和
48
h
时取
样
,
以去离子水作为对照
。
干旱胁迫处理
:
将茄子幼苗分别浸泡在
0
、
5%
、
10%
,15%
、
20%
和
25%
(
体积分数
)
的
PEG-6000
培养液
中处理
12
h,
取叶片进行基因表达水平检测
;
选择响应最显著的
PEG-6000
水平进行不同时间处理
,
具体
方法同盐胁迫
。
1.2
SmNTF3
基因的克隆
采用
Triozl
法提取茄子总
RNA
,
测定核酸浓度
,
使用
Goldenstar
TM
RT6
cDNA
Synthesis
Kit
(
擎科
)
的两
步法反转录获得
cDNA
。
将烟草
NTF3
(
NtMPK14
)
基因序列在茄子基因组数据库
(
/
)
中进行
BLAST
比
对
,
获得茄子同源序列
Sme2.5_02990.1_g00003.1,
命名为
SmNTF3
。
以茄子叶片
cDNA
为模板进行扩增
,
引物见表
1
。
将
PCR
产物连接至
pMD19-T
载体
,
转化大肠杆菌
,
阳性菌落送上海生工生物工程有限公司
测序
。
表
1
本研究所使用的引物序列
Table
1
Sequences
of
primers
in
this
study
引物名称
Name
of
primer
SmNTF3-F
SmNTF3
-R
引物序列
Sequence
of
primer(5'i3')
ATGGCAACTCCAGTTGAGCCAC
TCACATAACATCTCCCATTCCAGC
引物用途
Lsage
of
primer
编码区扩增
Amplification
of
coding
region
GFP-F
GFP-R
GGACTAGTATGGCAACTCCAGTTGAGCC
CGGGATCCCATAACATCTCCCATTCCAGC
亚细胞定位载体
Subcellular
localization
vector
实时荧光定量
PCR
RT-qPCR
茄子内参基因
Reference
gene
of
eggplant
qPCR-F
qPCR-R
SmEF-1a-F
SmEF-1a-R
AAGCTCATCCGTTGGCCATT
CCCAAGTCCTCGTCTATGTCAAG
CCACACTTCTCATATTGCTGTCA
ACCAGCATCACCATTCTTCAAAA
1.3
生物信息学分析
利用
ORF
finder
(
http
:
//
www.
ncbi.
nih
.
gov/gorf/gorf.
html
)
进行
SmNTF3
基因的开放阅读框预测
,
用
ExPASy
的
ProtParam
程序
(
http
:
//
web
.
expasy.
()
rg/protparam/
)
对蛋白理化性质进行分析
,
用
NetPhos
3.
1
(
http
:
//
.
dtu.
dk/services/NetPhos/
)
进行磷酸化位
点预测
,
通过
SMART
(
http
:
//
smart
.
emblheidel-
第
1
期
李婷
,
等
:
茄子
SmNTF3
基因的克隆及其表达模式分析
105
/)
网站进仃保寸结构域分析
,
用
Predict
Protein(
/)
和
SWISS-MODEL
(https
:
//
swissmodel.
expasy
.
org/
)
进行蛋白二级和三级结构预测
。
SmNTF3
同源序列由
NCBI
网站下载
,
利用
DNAMAN
6.0
软件进行氨基酸序列比对
;
MEGA
7.0
软件用
于构建进化树
,
采用邻接法
(
Neighbor-joining
method)
绘图
‘
bootstrap
设置为
1
000
。
1.4
SmNTF3
-GFP
载体的构建与亚细胞定位
将
SmNTF3
基因序列去除终止密码子
,
设计用于亚细胞定位的特异性引物
(
表
1)
,
扩增目的片段并构
建克隆载体
,
经
Spe
I
和
Bam
H
I
双酶切连接至载体
pCAMBIA1305
,
构成重组质粒
SmNTF3-GFP
。
利用农
杆菌介导法将构建好的融合载体与
Marker
共同转化烟草叶片细胞
,
正常培养
2~3
d
后
,
选择长势良好的
叶片进行制片
,
置于激光共聚焦显微镜下观察
。
1.5
实时荧光定量
PCR
根据
SmNTF3
基因序列设计特异引物
,
以茄子
EF-1a
为内参基因
,
引物序列见表
1
。
RT-qPCR
具体步
骤按照
2XTSINGKE
Master
qPCR
Mix(SYBRGreenI)
(
擎科
)
说明书进行
。
一次平行试验设
3
组重复
。
通过
熔解曲线结果分析引物的可用性
,
相对定量结果以
2
-AA
C
t
计算
。
采用
Excel
2007
和
SPSS
19.0
软件进行数
据统计与分析
。
2
结果与分析
2.1
茄子
SmNTF3
基因的克隆及测序
以
’
苏崎
1
号
’
叶片
cDNA
为模版
,
扩增得到大小约
1
100
bp
的目的片段
(
图
1)o
经测序及
ORF
FINDER
分析
,
SmNTF3
长度
Marker
SmNTF3
bp
2
000
为
1
119
bp,
编码
1
个含有
372
个氨基酸残基的蛋白
,
该序列与茄
子基因组数据库
Sme2.5_02990.1_g00003.1
基因序列完全一致
。
2.2
SmNTF3
蛋白的结构分析
采用
ProtParam
工具对
SmNTF3
蛋白的生化特性进行分析
,
1
000
1
119
bp
结果显示
SmNTF3
蛋白的相对分子质量为
42
699.36,
等电点为
6.32,
总平均亲水系数
(GRAVY)
为
-0.260,
说明它是
1
个亲水
750
500
蛋白
。
利用
NetPhos
网站对
SmNTF3
蛋白序列进行磷酸化位点预
测
。
结果
(
图
2)
显示
:
SmNTF3
蛋白有潜在磷酸化位点
32
个
,
丝
250
100
氨酸
(
Ser)
、
苏氨酸
(
Thr)
和酪氨酸
(
Tyr
)
位点分别为
15
、
9
和
8
个
。
其中
109
、
188
、
256
和
313
位的
Ser,195
位的
Thr
和
197
位的
Tyr
磷酸化概率较高
,
推测是
SmNTF3
激酶的磷酸化位点
。
图
1
SmNTF3
基因的
PCR
扩增产物
Fig.
1
The
PCR
product
of
SmNTF3
gene
对
SmNTF3
蛋白结构域进行分析
,
发现在第
32~319
氨基酸残基处有
1
个丝氨酸
/
苏氨酸激酶催化结
构域
(
S_TKc)
。
S_TKc
是
MAPK
家族的保守结构域
[
19
]
,
提示
SmNTF3
属于茄子
MAPK
家族
。
丝氨酸
Serine
;
------
苏氨酸
Threonine
;
-------
酪氨酸
Tyrosine
;
-------
阈值
Threshold
I
&
p
u
o
l
o
d
U
O
B
E
B
o
q
d
s
o
q
d
序列位置
Sequence
position
图
2
SmNTF3
磷酸化位点预测
Fig.
2
Predicted
phosphorylation
或
tes
in
SmNTF3
106
南京农业大学学报
第
44
卷
蛋白二级结构分析结果
(
图
3
)
显示
,SmNTF3
蛋白中无规则卷曲占
44.
35%,
a
-
螺旋占
35.
75%,0
-
折
叠占
19.89%,
并具有
17
个蛋白结合位点
。
进一步对其三级结构进行分析
(
图
4
)
,
结果显示
SmNTF3
折叠
交错呈复杂的三级结构
,
在
C
端多为
a
-
螺旋
,
而
N
端
0
-
折叠较多
。
21
42
63
84
105
1
..............................................
|
126
147
|
168
189
210
231
252
273
294
315
336
.............................................
‘
I
‘
「
_
369
I
I
1
IT
17
I
H
T
T
■
III
■
■
■■
■■
I
■
■
I
■
■
S
)
IE
■
Y
I
IT
i
■
iiiiiii
■
■
ii
■
in
ill
bi
ii
11
iiiiaiui
mi
ii
图
3
SmNTF3
蛋白二级结构预测
Fig.
3
The
predicted
secondary
structure
of
SmNTF3
protein
2.3
SmNTF3
同源性比对与进化树分析
利用
NCB1
数据库检索
SmNTF3
同源序列
,
对茄科及拟南
芥中的
NTF3
同源序列进行比对
,
结果
(
图
5
)
显示
,
整体序列
相似度高达
87.06%,6
条氨基酸序列均具有
MAPK
家族的
11
个保守亚结构域
,
第训和第
W
亚域之间存在
TEY
激活位点
。
SmNTF3
与番茄
SlMPK9
(
C
组
MAPK
)
及马铃薯
StNTF3
的同
源性最高
(
98.39%
)
,
与辣椒
、
烟草和拟南芥的序列同源性分别
为
96.77%
、
96.24%
和
84.95%
。
以上结果表明
SmNTF3
属于
MAPK
家族
C
组成员
,
茄科
NTF3
序列保守性较高
。
利用
MEGA
7
对
14
个物种的
NTF3
蛋白序列构建系统进
图
4
SmNTF3
三级结构模型
Fig.
4
Tertiary
structure
model
of
SmNTF3
8
o
8
o
8
o
8
o
8
o
8
o
化树
,
结果
(
图
6
)
显示茄科的
5
种植物聚为同一分支
,
茄子
SmNTF3
S1MPK9
StNTF3
CaNTF3
NtNTF3
AtMPKl
Consensus
SmNTF3
S1MPK9
StNTF3
CaNTF3
NtNTF3
AtMPKl
Consensus
SmNTF3
S1MPK9
StNTF3
CaNTF3
NtNTF3
AtMPKl
Consensus
LGSQREE
SmNTF3
NQ]
LKLI
平
H
ilgsqree
NQ]
LKLI
S1MPK9
”
血
GSQREE
NQ]
iiai
StNTF3
CaNTF3
NQ]
JOI
NILGSQREI
NtNTF3
NQ]
1KLI
NILGSQREI
NILGSQREI
AtMPKl
NQ]
Consensus
nqlkli
嘲
ESS
疋
MAT
GKHY
GKHY
GKHY
-?j
GKHY
T?|
GKHY
N
耳
GKHY
■EIDTIGl
PIKPIGRGAYG
辽创诙册
RET
HEKVAIKKI
j
EIDTKY
PIKPIGRGAYG
jllMBMSfflfllRES
NEKVAIKKI
-EIDTKY
PIKPIGRGAYC
NEKVAIKKI
H
阳舸炯
RET
NEKVAIKKI
iEIDTKY
PIKPIGRGAYC
打
EKVAHKKT
iEIDTiq
PIKPIGRGAYG
'EIDTK^
PIKPIGRGAYC
!VgMaSMMfll3DT
HEKVAIKKI
--F
2
z
z
■J
2
-
SaMaaMoiRET
DALRTLREI
DALRTLREL
DALRTLREL
DALRTLREL
DALR
TLREI
DALRTLRE1
.RHLRHENVIALKDVMMPI
:
.RHLRHENVI^LKDVMMPI]
.RHLRHENVULKDVMMPD
■RHLRHENVIALKDVMMPI]
■RHLRHENVIALKDVMMPI]
.RHLRHENVIALKDVMMPI]
IV
|SFKDVYLVYKLMDTD
LHQ
:
[|
;
FKDVYLVYELMDTnLHQ"
iCQYFLFQLLRGLKYHHSANILHRDLK
SFKDVYLVYEDMDTDLHQI
SFKEVYLVYEL^DTDLHQI
SFKDVYLVYELMDTDEHQI
SFKDVYLVYELMDTDLHCI
iCGYFLFGLLRGLKYMHS7NILHRDLK
iCQYFLFQLLRGLK^
gHSANILHRDLK
iCQYFLFQLLRGLld
iCQYFLFQLLRGLK^
0HSANILHRDLK
B
hsanilhrdlk
HQYFLFQLLRGLKYgHSANTLHRDLK
60
60
60
60
60
60
EYVVTRWYRAFELLLCCDNYGTSIEVWSVGCIFAELLGRb
EY^mRWRAPELLLCCDNYGTSIDVWSVGCIFAELLGRF
24
24
24
24
24
24
o
o
o
o
o
o
SRLYE
MLVFEPSKRISV
EALQHPYN
SRLYI
SAH
[LAIELLQg
MLVFEPSKRISV
EALQEPYM
smi
MLVFDPSKRISV
MLVFEPSKRISV
EALQHPYN
SRLYi
S
ahslaiell
^
SRIYI
S
ah
I
lazellq
MLVFEPSKRISV
EALQHPYL-1
圈耐轉盹
i
、
i
MLVFDPSKRISV
EALQHPY?
S
a
H5LAIDLL<^
sr
E
ye
32
o
3
2
o
3
2
o
3
2
o
3
2
o
3
2
o
ealqhpym
SA.-.TAGMGLV
EA=TA-WEEV
SmNTF3
S1MPK9
StNTF3
CaNTF3
NtNTF3
AtMPKl
Consensus
二
.TMMEEV
r.--APME.-.V
371
371
371
371
371
371
图
5
茄子与其他物种的
NTF3
氨基酸序列比对
Fig
・
5
Alignment
of
amino
acid
sequence
of
NTF3
protein
in
eggplant
and
other
species
Sm
:
茄子
Solanum
melongena
;
Sl
:
番茄
Solanum
lycopersicum
(
NP_001233761.1
)
;
St
:
马铃薯
Solanum
tuberosum
(
XP_006341972.
1)
;
Ca
:
辣椒
Capsicum
annuum(XP_016568515.1)
;
Nt
:
烟草
Nicotiana
tabacum
(
Q405
17.1)
;At
:
拟南芥
Arabidopsis
thaliana
(
NP
172492.1).
下同
。The
same
as
follows.
I
—卫
分别表示
MAPK
家族
11
个保守亚结构域
,
红色方框标注出
TXY
双磷酸化位点
。
I
-卫
indicate
the
11
conserved
subdo
mains
of
the
MAPK
family
,
and
the
red
box
indicates
the
TXY
double
phosphorylation
site.
第
1
期
李婷
,
等
:
茄子
SmNTF3
基因的克隆及其表达模式分析
—
SH1NTF3
■jr
StNTF3
(XP_006341972.1)
107
SmNTF3
与来自番茄和马铃薯的同源序列亲缘关系最
近
。
除茄科外
SmNTF3
与大花牵牛及油橄榄等进化关
系相对较近
,
而与拟南芥
、
西葫芦
、
狭叶羽扇豆等亲缘关
系较远
。
2.4
SmNTF3
亚细胞定位
在
SubLoc
v1.0
database
数据库中对
SmNTF3
进行
分析
,
预测结果显示其定位于细胞核和细胞质膜中
。
将
SmNTF3
-GFP
与
Marker
载体转化烟草叶片进行瞬时表
达
,
采用激光共聚焦显微镜进行观察
,
结果
(
图
7
)
显示
,
H
-----
0.01
L
S1MPK9
(NP_001233761.1)
--------
CaNTF3
(XP_0
16568515.1)
-
NtNTF3
(Q40517.1)
InNTF3
(XP_019153326.1)
------------
OeNTF3
(XP_022852976.1)
--------------------
HaNTF3
(XP_02
1983730.1)
I
—
—
RcNTF3
(XP_02416547Xl)
------
FvNTF3
(XP_004291845.1)
—
CsNTF3
(XP_006473550.1)
—
------------LaNTF3
(XP_0
19459013.1)
--------------
AtMPKl
(NP_1
72492.1)
-----------------
CqNTF3
(XP_02
1759925.1)
在细胞核和细胞质膜上均能看到
SmNTF3-GFP
融合蛋
白绿色荧光
,
且与
Marker
红色荧光蛋白完全重叠后呈
黄色
,
说明
SmNTF3
可能定位于细胞核和细胞质膜
。
2
・
5
SmNTF3
基因组织表达分析
图
6
不同物种
NTF3
氨基酸序列的系统发育分析
Fig.
6
Phylogenetic
analysis
of
amino
acid
sequences
of
NTF3
from
different
species
In
:
大花牵牛
Ipomoea
nil
;
Oe
:
油橄榄
Olea
europaea
var.
sylvestris
;
Ha
:
向日葵
Helianthus
annuus
;
Rc
:
月
季
Rosa
chinensis
;
Fv
:
野草莓
Fragaria
vesca
subsp.
vesca
;
Cs
:
甜橙
Citrus
sinensis
;
La
:
狭叶羽扇豆
Lupinus
angustifolius
;
Cq
:
西葫芦
Cucurbita
pepo.
对
SmNTF3
基因在茄子发育过程中的组织表达模
式进行分析
,
结果
(
图
8
)
显示
:
SmNTF3
在茎中表达量
最高
,
显著高于根和叶
,
在根和叶中表达量无明显差异
,
说明
SmNTF3
在茄子中呈现组织特异性表达
。
SmNTF3
・
GFF
Marker
Merged
GFP
:
核
Marker
(Nuclear
marker)
GFP
:
质膜
Marker
(Plasma
membrane
marker)
图
7
SmNTF3
亚细胞定位
Fig.
7
Subcellular
localization
of
SmNTF3
Bar=
20
ixm.
2.6
SmNTF3
在盐胁迫下的表达分析
从图
9
可知
:
SmNTF3
的表达随
NaCl
处理
浓度的增加呈先上升后下降的趋势
,
在
100
mmol -1 NaCl 浓度胁迫下表达量最大 , 约为对 u .2 s s a l d x Q A B E ls a 2.0 1.5 ** 1.0 0.5 照的 2 倍 ( 图 9-A ) 。 选择 100 mmol-L -1 NaCl 进 行不同时间处理试验 , 结果 ( 图 9-B ) 显示 , 盐胁 迫处理 3 h, SmNTF3 表达量显著上调 , 而后逐步 0 艮 Root 茎 Stem 组织 Tissue 叶 Leaf 下降 , 胁迫处理 48 h, SmNTF3 的表达量与对照 图 8 SmNTF3 的组织表达分析 Fig. 8 Expression profiles of SmNTF3 in eggplant * P<0.05 , * * P<0.01. The same as follows. 差异不显著 。 以上结果说明 SmNTF3 基因响应 盐胁迫 。 108 南 京 农 业 大 学 学 报第 44 卷 1S A 2 I A. 不同浓度的 NaCl 处理 12 h 时 SmNTF3 基因表达量变化 Changes of SmNTF3 gene expression level after treatment with different oonoentrations of NaCl for 12 h ; B. 100 mmol*L -1 NaCl 处理不同时间后 SmNTF3 基因表达量变化 Changes of SmNTF3 gene expression level after treatment with 100 mmol • L-1 NaCl at different time. 2.7 SmNTF3 在干旱胁迫下的表达分析 从图 10 可知 : PEG-6000 胁迫处理显著诱导 SmNTF3 基因的表达 , 在 PEG-6000 含量为 5% 、 10% 和 15% 时 SmNTF3 表达量持续上调 , 在 15% PEG-6000 时表达量最高 , 是对照的 6.5 倍 ( 图 10-A ) 。 选择 15% PEG-6000 进行时间处理试验 , 结果 ( 图 10-B ) 显示 : 随处理时间的延长 , SmNTF3 表达量呈先上升后下降 趋势 , 在 12 h 达到最高 。 这些结果说明 SmNTF3 基因响应干旱胁迫 。 * 澈 臺 Fig. 10 Expression level analysis of SmNTF3 gene under PEG-6000 simulated drought stress A. 不同含量的 PEG-6000 处理 12 h 时 SmNTF3 基因表达量变化 Changes of SmNTF3 gene expression level after treatment with different contents of PEG-6000 for 12 h ; B. 15% PEG-6000 处理不同时间后 SmNTF3 基因表达量变化 Changes of SmNTF3 gene expression level after treatment with 15% PEG-6000 at different time. u .2 SSUJdxg O A 9 E H 图 9 盐胁迫下 SmNTF3 基因的表达量分析 Fig. 9 Analysis of SmNTF3 expression level under salt stress 15 A 3 u .2 SSQJdxoOAgzIOM PEG-6000 含量 /% PEG-6000 content t/h 图 10 PEG-6000 模拟干旱胁迫下 SmNTF3 基因的表达量分析 3 讨论 MAPK 是一类丝氨酸 / 苏氨酸 ( Ser/Thr ) 蛋白激酶 , 在真核生物中具有高度的进化保守性 [5 ] 。 NTF3 基 因最早作为 MAPK 同源体在烟草中被克隆 , 基因鉴定发现其属于 MAPK 家族 C 组成员 [ 18 , 20 ] 。 本研究从茄 子 ' 苏崎 1 号 ’ 中克隆得到 SmNTF3 基因 , 其编码蛋白具有保守的 S_TKc 结构域 。 S_TKc 结构域包含 TXY 双磷酸化位点 , 这是上游基因进行磷酸化的部位 。 通过磷酸化位点预测 , 我们寻找到 SmNTF3 蛋白可能发 生磷酸化的氨基酸残基位置 , 这对茄子 MAPK 级联途径的研究具有重要意义 。 氨基酸序列分析表明 SmNTF3 包含 MAPK 基因的保守结构域和 TEY 基序 , 与 MAPK 家族 C 组成员序列高度同源 , 认为 SmNTF3 属于 C 组 。 系统发育分析显示 SmNTF3 与来自番茄及马铃薯的同源序列亲缘关系最近 , 同源性明显高于 其他物种 , 说明茄科 NTF3 同源序列高度保守 。 此外 , SmNTF3 与拟南芥 、 西葫芦等同源性也较高 , 说明 NTF3 在不同物种中均具有保守性 , 这在其他物种 MAPK 基因的研究中有相似结论 [ 21 ] 。 MAPK 作为将信号分子从细胞表面传递到细胞核的重要因子 , 主要在细胞核上表达 , 部分 MAPK 也 可能在细胞质或细胞膜等部位磷酸化特定的蛋白⑷ 。 已有研究报道番茄 SlMPK7 定位于细胞核和细胞 膜 [ 22 ] ; 玉米 ZmMPK3-1 主要定位于细胞膜和细胞核 [ 23 ] ; 玉米 ZmMPK5 定位于细胞核 、 细胞质和细胞 膜 [ 24 ] 。 本研究通过 SmNTF3 在烟草叶片中的瞬时表达发现其定位于细胞核和细胞质膜 , 与上述研究结果 一致 , 也与其功能相符 。 第 1 期 李婷 , 等 : 茄子 SmNTF3 基因的克隆及其表达模式分析 109 在植物 MAPK 的研究中 , 尽管 C 组研究相对较少 , 但已有的文献能够表明不同物种的 MAPK 家族 C 组成员广泛参与植物生长发育与外界刺激响应过程 。 目前研究较充分的是拟南芥中的 4 个 C 组 MAPK 基因 : AtMPK1 、 AtMPK2 、 AtMPK7 和 AtMPK14 。 机械损伤和茉莉酸 ( JA) 诱导拟南芥 AtMPK1 和 AtMPK2 的 表达 [25] ; AtMPK1/2 参与的级联途径能够有效调控拟南芥对盐胁迫的耐受性以及植物的衰老过程 [26-27] ; AtMPK7 和 AtMPK14 在植物响应病原菌的防卫过程中起关键作用 [28] 。 此外 , 豌豆 PsMPK2 对机械损伤 、 脱落酸 ( ABA) 和过氧化氢等信号分子的诱导产生响应 [29] ; 番茄 SlMPK8 和 SlMPK9 在热胁迫下表达量显 著上调 [30] ; 烟草 NtNTF3 在 JA 和干旱处理时上调表达 [18] 。 在本研究中 , SmNTF3 基因在盐和 PEG-6000 干旱处理下响应显著 , 说明 SmNTF3 可能参与植物对盐及干旱胁迫的应答过程 , 这些结果为进一步研究该 基因的生物学功能提供理论依据 。 参考文献 References: [1] 刘丹 , 崔彦玲 , 潜宗伟 . 茄子种业现状及遗传育种研究进展 [J]. 北方园艺 ,2019( 1):165-170. Liu D , Cui Y L , Qian Z W . Research advances in the seed industry and breeding of eggplant [J]. Northern Horticulture ,2019( 1) : 165 -170 ( in Chinese with English abstract). [2] Golldack D , Li C , Mohan H,et al. Tolerance to drought and salt stress in plants : unraveling the signaling networks [J]. Frontiers in Plant Soienoe ,2014,5 : 1- 10. [3] Xu J , Zhang S. Mitogen-activated protein kinase cascades in signaling plant growth and development] J ]. Trends in Plant Science ,2015,20( 1) : 56-64. [4] Goyal R K , Dan T , Chomistek N , et al. Analysis of MAPK and MAPKK gene families in wheat and related Triticeae species [J]. BMC Genomics , 2018,19(1) : 2-26. [5] Zhang M,Su J , Zhang Y , et al. Conveying endogenous and exogenous signals : MAPK cascades in plant growth and defense [J] . Current Opinion in Plant Biology,2018,45 : 1-10. [6] Smekalova V. Involvement of YODA and mitogen activated protein kinase 6 in Arabidopsis post-embryogenic root development through auxin up-regulation and cell division plane orientation [J]. New Phytologist ,2014,203 (4) : 1175 - 1193. [7] Zhou C , Cai Z ,Guo Y , et al. An Arabidopsis mitogen-activated protein kinase cascade , MKK9-MPK6 , plays a role in leaf senescence[J]. Plant Physiology ,2009,150(1) : 167-177. [8] Chen L , Sun H , Wang F , et al. Genome-wide identification of MAPK cascade genes reveals the GhMAP3K14-GhMKK1 1 -GhMPK3 1 pathway is involved in the drought response in cotton [J]. Plant Molecular Biology,2020,103 : 211-223. [9] Lewis T , Shapiro P , Ahn N. Signal transduction through MAP kinase cascades] J ]. Advances in Cancer Research , 1998,74 : 49 - 139. [10] Cai G , Wang G , W ang L , et al. A maize mitogen-activated protein kinase kinase , ZmMKK1 , positively regulated the salt and drought tolerance in transgenic Arabidopsis[J] . Journal of Plant Physiology,2014,171( 12) : 1003 - 1016. [11] Jalmi S K , Sinha A K. Functional involvement of a mitogen activated protein kinase module , OsMKK3-OsMPK7-OsW''RK30 in mediating resistance against Xanthomonas oryzae in rice [J]. Soientifio Reports ,2016,6 : 1 - 14. [12] 叶文武 , 张萌 , 曹明娜 , 等 . 大豆疫霉 PsMPK1 沉默突变体的基因表达谱分析 [J]. 南京农业大学学报 , 2016,39(3) : 386-393. DOI : 10.7685/ jnau.201509026. Ye W W , Zhang M , Cao M N,et al. Gene expression profilling of a PSMPK1 - silenced mutant of Phytophthora sojae [J] . Journal of Nanjing Agri cultural U niversity ,2016,39(3) : 386-393( in Chinese with English abstract). [13] Ding H,He J,Wu Y ,et al. The tomato mitogen - activated protein kinase SlMPK1 is as a negative regulator of the high temperature stress response [J]. Plant Physiology,2018,1 77(2) : 633-651. [14] Ichimura K. Mitogen-activated protein kinase cascades in plants : a new nomenclature [J] . Trends in Plant Science , 2002,7(7) : 301-308. [15] 朱彤彤 , 杨磊 , 孙文秀 . 辣椒疫霉 MAPK 基因家族的鉴定及生物信息学分析 [J]. 生物技术 ,2018,28(5):460-466. Zhu T T , Yang L , Sun W X. Identification and bioinformatics analysis of the MAPK family in Phytophthora capsici [J]. Biotechnology,2018, 28(5) : 460-466( in Chinese with English abstract). [16] Zhang X , Xu X,Yu Y , et al. Integration analysis of MKK and MAPK family members highlights potential MAPK signaling modules in cotton [J]. Scientific Reports ,2016,6( 1) : 1-13. [17] Liu Q , Xue Q. Computational identification and phylogenetic analysis of the MAPK gene family in Oryza sativa [ J]. Plant Physiology & Biochemistry,2017 ,45(1) : 6 - 14. [18] Zhang X , Cheng T , Wang G , et al. Cloning and evolutionary analysis of tobacco MAPK gene family [J]. Molecular Biology Reports ,2013, 40(2):1407-1415. [19] Mohanta T , Arora P , Mohanta N , et al. Identification of new members of the MAPK gene family in plants shows diverse conserved domains and novel activation loop variants] J ]. BMC Genomics ,2015,16( 1) : 58. [20] Wilson C , Anglmayer R , Vicente O , et al. Molecular cloning , func-tional expression in Escherichia coli , and characterization of multiple mitogen- 110 南 京 农 业 大 学 学 报 activated-protein kinases from tobacco[ J ]. European Journal of Biochemistry^ ,2004,233( 1) : 249-257. 第 44 卷 [21] Wu P , Wang W , Li Y , et al. Divergent evolutionary patterns of the MAPK cascade genes in Brassica rapa and plant phylogenetics [J] . Horticul ture Research ,2017,4( 1) : 170 - 179. [22] 关小燕 , 陈丽妃 , 何艳军 , 等 . 番茄 SlMAPK7 基因的亚细胞定位与组织表达特性 [J]. 浙江大学学报 ( 农业与生命科学版 ) , 2014, 40( 6) :598-604. Guan X Y , Chen L F,He Y J,et al. Subcellular localization and tissue expression pattern of SIMAPK7 gene in tomato [J]. Journal of Zhejiang Lniversity ( Agriculture and Life Sciences Edition ) ,2014,40(6) : 598-604( in Chinese with English abstract ). [23] Liu Y , Wang L , Zhang D , et al. Expression analysis of segmentally duplicated ZmMPK3-1 and ZmMPK3-2 genes in maize [J]. Plant Molecular Biology Reporter,2013,31(2) : 457-463. [ 24] Ding H,Zhang A,Wang J,et al. 1dentity of an ABA-activated 46 kDa mitogen-activated protein kinase from Zea mays leaves: partial purifica tion , identification and characterization [J]. Planta ,2009,230(2) : 239-251. [25] Dolores O M , Amador P , Miguel A , et al. Diverse stress signals activate the C1 subgroup MAP kinases of Arabidopsis [J]. FEBS Letters , 2007 , 581(9) : 1834-1840. [26] Zhang J , Gao J , Zhu Z ,et al. MKK4/MKK5-MPK1/MPK2 cascade mediates SA-activated leaf senescence via phosphorylation of NPR1 in Arabi dopsis [J ]. Plant Molecular Biology ,2020,102 : 463-475. [ 27] Hwa C M,Yang X C. The AtMKK3 pathway mediates ABA and salt signaling in Arabidopsis [ J] . Acta Physiologiae Plantarum,2008,30( 3) : 277-286. [28] Ddczi R , Brader G , Pettko Szandtner A , et al. The Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase MKK3 is upstream of group C mitogen- activated protein kinases and participates in pathogen signaling[ J ]. The Plant Cell,2007 ,19( 10) : 3266-3279. [29] Dolores O M , Miguel A , Amador P , et al. Characterization of PsMPK2 , the first C1 subgroup MAP kinase from pea ( Pisum sativum L.) [J]. Planta,2008,227(6) : 1333-1342. [ 30] Kong F,Wang J,Cheng L,et al. Genome-wide analysis of the mitogen-activated protein kinase gene family in Solanum lycopersicum[ J] . Gene, 2011,499(1) : 108-120. 责任编辑 : 刘怡辰
发布者:admin,转转请注明出处:http://www.yc00.com/web/1713198466a2202324.html
评论列表(0条)