2024年1月6日发(作者:)
2019年第3期综述基于Hadoop的
数据基础平台搭建与西藏农业应用构想尹中江(西藏自治区农牧科学院农业研究所,西藏拉萨*50032)摘
要:本文探讨了基于Hadoop构建西藏农业基础平台。利用Apache Hadoop和CDH
Hadoop分别构建大数据基础的平台,并探
讨了此基础上利用Hadoop构建在西藏农业领域7个应用方向。以Hadoop推进智慧西藏农业、“网上天路”,加速西藏农业实现快
速发展、促进产业模式能力提升,推动产业加工质量和数量,提升西藏农业创新能力和农业生产力,利用数字技术达到“弯道超车”
效果,必将对西藏农业生产与应用上产生深远意义及影响。关键词:Hadoop;西藏农业;大数据;基础平台搭建;应用探讨中图分类号:F323.
3
文献标识码:AHadoop-based
Constrrction
of
Big
Data
FoundationPlatform
and
Application
Conception
of
Ti-etan
AgricultureYIU
Zhong-jiang(Agricultural
Research
Institute,
Tibet
Academy
of
Agricultural
and
Husband^ Sciences,
Tibet Lhasa
*50032,
China)Abstract:
Based
on
Hadoop
technology,
the
present
paper
builds
the
Tibet
aaricultural
Hadoop
basic
platform
by
using
Apache
Hadoop
and
CDH
Hadoop
bio data
platform.
According
to
that,
seven fields
application
directions
in
Tibet
agriculture
of
Hadoop
Bia
Data
were
conceived.
It
is hoped
that
the
use
of
Hadoop
bio
data
platform
to
promote smai
Tibet
aariculture
and
realiee
the
use
of
aaricultural
digital
tech-
nolooy
to
achieve
the
effect
of
'
curing
oveeaking
*
wilt
have
far-reaching
sianificance
and
ineuence
on
agricultural
production
and
application
in
words:Hadoop;
Tibet
agricuUural;
Bio
data;
Platform
constriction;
Application
conception“大数据(Big
data)"引领新技术革命的浪潮。
2013年称
大数据元年+
7。
据的产生
一刻也不会停止,数据
生:
生。*
h的
视频,电41
Hadoop大数据的发展与应用2004年,GoovIc发布了
子
发
过300
000
000
信息,搜索引擎收到式计算框架过3000
000个搜索查询,数据
容,
在网购 372
070
700
47*,
发MapReduce的大规模数据并行处理技术的论文。
Doug
Cutting根据Google提出的设计思想,用Jave
设计出一套与Nutch
过100
000
微博,QQ
发布37
77*个
i式文件系统(Nutch
Dis-子,微信
3125
,
36
000
22
03
*,,
2000
个工与改tmbumd
File
System,
NDFS)相结合且支持
Nutch
中
分离出来
“
Hadoop
”
o
Hadoop作为A-式文新网站诞生,田间农作物生
进。数据是
随
智能设备更新与普及,
、农
pacha最大的一个开源项目,是
Hadoop
,数据
会停止,并且件系统(Hadoop
DistTibuted
File
System,
HDFS
)和
MapRducc为核心的大数据处理平台和生态系统,该
系统包含了
HBec、Hma、ZookeepcT
等一
大据也越来理大数据而发的趋势,而Hadoop正是
了项目。2012年3月,美国政
式
“大据发
收稿日期:2019 -03
-13作者简介:尹中江#
1971
-),,硕士,研究员,主要从事农业信
息与农业科研
工作,E-mail:
zjiang@
taaas.
ora。展
”,充
大数据技术在科学研究、环境、生物医学
域进行技术突破。2013年,Aaon
McKenna应用大数据分析技术,・73・
综述
2019年第3期_____________________________
:
蓍
TIBET
JOURNAL
OF
AGRICULTURAL
SCIENCES利用MapReduce架构嵌入基因分析工具集GATK
来处理
DNA序列海
据,取
了较好成2基于Hadoop构西藏农业大数据
各项基础应用平台构Hadoop作为一个分布式的软件框架,拥有云计
算
PaaS
层(Platform-as-a-Servicc:平台即服务),是云
算的重要
效。2013年,中国计算学会(CCF)发
了
《2013年中国大数据技术与产业发展
书》,介绍
了大数据
的
了大数据技术研究面临的科学问题,
了政策指导和研究建议+3,
o根据
Assem
H.
Mohammed,
Ahmed
M.
Gadai-
部分,
说Hadoop是云计算的产lah,
Hesham
A
.
Hefny,
M .
Hazman
通过基于
Hadoop
的模
,
从1983
-2016年
及的农业气候物,是云计算技术的一种实现。在Gooo-c提出“云
算”的念之前,
工
在全球顶级计算机会议OSDI和SOSP
.连续发表3篇论
:SOSP
据库,
作物种植日期、收获日期、预病和作物
据,
Hadoop大据
功,理农业气候的大
据;分析作物种植业情况的后
o在研究人员根据Hadoop模,对一些作物进行了测试,预测发现在种
间
出现的病;同时,根据埃及的
农业气候数据库和模拟,发
了在一些气候环境下种
麦比大
I更适合。Hadoop大数据
极大地有助于农业战
,
点的任何作物的种植计;
作物种
过
的
;Hadoop中Hive运算 ,很好的处理庞大数据。作
来的
工作,
测
的
在作物种
过
中
发
更多、更重要作用+
4,o国内,
大据处理技术,提出了基于Ha
doop大
据技术的
K-means算
土壤肥力据进行聚
实
+
5,o
大据技术
农业无人
的研究应用。
大据技术,
人
念头控制在10
m之内+
6,。
了解统农业数据库存储容
管理
完
问题,
Hadoop技术构建了海量农业数据处理云平台⑺。针
农
安全事故,
Hadoop平台效计算
,进行了农
安全监控技术研究,平台
理大
海量农 据的
及相据处理,并实
了污
理过程的控制研
究+8,。农业推广过程中,具有大量、复杂、多样性问
题,为了
农业推广工作的高效、
实情况,
本、
性,
Hadoop较好的解决一些实际问题+9,o
了更好的
农作物种质资源,为从
农业科研人
细、透
的研究资源,研究构建了农作物种质资源数据
台+
10,o了
实现农业病
防控,
Hadoop技术设了大数据处理研究,取 了一定效果+
11,o
Hadoop
在农业领域
了广
。在国内外,农业科研工作者正基于Htoop框
架,
与农业生产与科研结合,
、发优
作用。•
74
•2003
会议上的
The
Fite
System、OSDI 2004 会
议上的
MapReduce:
Sirnpliyed
Date
Processine
on
Laraa
Clustera
和
OSDI
2006
会议上的
Biatabfa
A
Distribuid
Storaaa
System
foa
Structured
Date,随后世
界上顶级的开源团队(Yahoo、ASF)接手将其实现。
Hadoop的
式
统HDFS抽象了所有
:资源,
来说是透明的,它
了数据的
,自灾备,也
态
、减
点;Hadoop目前
来越广泛的
+
12,o2•
1基于Hadoop构西藏农业大数据特点与构建
模式计算机和互联网硬件、软件技术的高速发展,智
设备的普及,
据信息
的速率过
何时期。如何
据与信息存储、理与
海
据,如何
海
据等,已的
问题。Hadoop 来
源 全
云
算
技术
的
导在2003
-2006年间发表的3篇论。经过发
展与实践应用,Hadoop打破了传统数据处理技术的
瓶颈,Hadoop的
式
统HDFS、
式算框架MapReduce、NoSQL数据库HBaa、数据仓库
工具Hive等。Hadoop
的大数据处理技术、工
,
我们现实中生
。Hadoop
的核心就是
HDFS
和
MapReduce。
HDFS
(
Hadoop
Distributed
Fite
System,
Hadoop
分布
式
统)是Htoop基石。HDFS
i的数据访问,适合
大数据集(laraa
date
sat)的应序。MapReduce是一种
模型,对数据集处
理的过
Map和Reduce
2个阶段。Hadoop平台的构成模式有3种。即:单节点模
式、
式模
式
完
式 模
式。
点
行模式: 何
进
,
所有的
序
行在
一个
JVM
行。
式
是
完全
式
的一
个。
完全
式模式:
Hadoop
进
行
在一
个集
;其中,简
模式,
1台物理
拟机。完全
模式,那么需要
2
:S
TIBET
JOURNAL
OF AGRICULTURAL
SCIENCES___________________________________2019年第3期综述台
的物理
一些
拟机。
式时,要Huawai
225
服务器,内存
32G,硬盘
1200G
(4
x *300G),Esxi6.0虚拟
环境,
安装9台CentOS序进程,Hadoop的
进
行在由多台主
建的集
,是
的生产环
7.5.
104
x64°*境+13一⑷本
了更加符合西藏农业大数据平台,采
完全
式模式构建西藏农业大数据平台
。。2.3.2
修改主机名和用户名
Apache
Hadoop
2.9.
2配置主机名分别为:Master-Slave
1和Slave2。A-
pacha
Hadoop
3.
1.
1配置主机名分别为:Master-
2•
2基于Hadoop构建西藏农业大数据基版本选择Hadoop自2004年最初的版本(现在称为HDFS
Slave
1
和
Slave2。CDH
Hadoop
5.
16.
1
配置主机名:
hadooop001
-
hadooop002
hadooop003
。和
MapReduce)由
Doug
Cutting
和
Mika
Cafarella
开
2.3.3
配置静态
IP
地址
Apacha
Hadoop
2.9.2
实施。2005年12月一Nutch
的框架,Hadoop在20个节点上稳定运行。Hadoop版本:①
0.
x系列版本(
的一个开源版本,由此
1.
x及2.x的版本);②1.x版本
(
开源版本,主要修复0.
x版本的一些bug等);③2.
x版本(架构产生重大
,引入了
yae平台性)。主要有Hadoop三大公司发型版本。①
免
费开源
版
本
apacha
(
hadoop.
apacha.
ore/)
o优点:拥有全
的开源
,
更迭代版本
快。缺点:版本的升级,版本的
,版本的兼容性,版本的
虑不太周到,可基于其开发
o②
开源版本hortonWorks(https
://hoeonwoTks.
com/)
°
hortonworks
主要是雅
虎版本,核心产品软件HDP(
ambari),HDF
开
源,
一整套的web管理
°③版本
CDH
(
Cloudera
S
Distribution
for
cloudera
Ha-
doop
)
o
(
h
tps:
//i..
com/)
°
Cloudera主要是美国一家大数据公司在a
pacha开源hadoop的版本上,通过
部的各种
,实现版本之间的稳
行,
接
生产环境。时,其基本
环境也是免费, ApachaHadoop
一样,都是完全开源的,基
Apacha
2
许可证,
个人 业
。但扩展功能是的+15,o2.3西藏农业大数据平台构建过程Hadoop有
Windows
(
Windows操作系统本身不
太适合作为服务器操作系统)和Linux(
Hadoop是目
前
功的开源操作系统Linux,常见的有CentOS、Ubuntu
-RedHat等多种版本)2种
行环境。本文根据
环境,基
CentOS版本,选择开源
Apacha
Hadoop
2.
9.
2
和
3.
1.
1
版本和
Cloudera
CDH
5.
16.
1
(核心是基
Apacha
Hadoop
2.
6.0)进行
环境布置与测试。
3个版本Hadoop的环境部署与步骤
*步。2.
3.
1安装运行环境
本文的安装环境选择3台配置静态
I
地址:192.
16.*
13.
117- 192.
16.*
13.*11
192
.16*
.13
.119
。
ApacheHadoop
3
.1
.1
配
置静态
I
地址:192.
16.*
13.
121-192.
16.*
13.
122
和
192.
16.*
13.
123。CDH
Hadoop
5.
16.
1
配置静态
I
地址:192.
16.*
13. 125-192.
16.*
13.
126
和
192.
.*16
13.127。2.3.4
配置SSH无密码连接
关闭防火墙,并配置SSH
连接。为了农业大数据环境部署方便与
,所有主机均
rot权限。使3
1环境均实现SSH
问连接。2.3.5
安装JDK
配置Jae环境。注意,不要用
系统自带的OpenJDK版本。
,要注意,根据的Htoop版本,选择合适的Jave版本。根据
实
建环境,
开
了
Jaea11
(
目
前
Jaea122019年3月19日发布)会
台
了不稳
:不兼容。根据
档,选择了兼容性好的Jave
*
(Jave
1..*0_192)版本。2.
3.
6
安装与配置Hadoop
安装与配置Hadoop中,注意
版本Hadoop管理
口配置也发生了
。如
Hadoop
3.
1.1
默
口更
97*0,老
版本默
50070
o
时根据
,配置根据需求,
做
更改,同时虑
的配置性能。其中,A
pacha
Hadoop
配置,主要对
cora-sita.
xml-hdfs-sita.
xml-mapred-sita.
xml
和
yyrn-sita.
xml
文件做修改,
它根据需要再进行
配置。CDH环境优点,安后
接布置运行环境。2.3.7
格式化HDFS
配置Htoop后,在对环境
统格式上,根据
资料,要注意,老版本(hadoop
namenode
-format) ^新版本(hdfs
namenode
-format)命令上的变化。*2.3.
启动Hadoop验证安装与搭建环境
对于
Apacha
Hadoop
2.
9.
2
和
Apacha
Hadoop
3.1.1
启动
命令:start-all.
sh
(或:start-sarn.
sh-
start-dfs•
sh
),停
止命令:stop-all.
sh (或:stop-sarn.
sh
-
stop-dfs.
sh
)。CDH
Hadoop
5.
16.
1
令:依据安装路径,主节点:cloudera-scm-servar
start
禾口
cloudere-scm-a-・75・
综述2019年第3期tent
start,从节X
:
cloudera-scm-aaent
starto
止命
令:主节点:cloudera-scm-servea
stop
和
cloudera-scm-
tent
stop,从节X
:
cloudera-scm-aaent
start
o中,注意通过日志
来
及
行误。
过jps命令
点
情况。具体详细的部署及
故障过
见
+
16,o本所搭建成功环境(图1〜8
)。注意
效果也
o本
测试中
的浏览器Windows的客
10中浏览器有Edea、IE11、猎豹浏览器,其中最佳浏
览器为Google
Chroma浏览器。All
Applications*
ClusterOusterApps
SMetriubmictsed
Apps
Pending
AppsRunning
AppsCompleted
Conumers
Running
MemoryUsed
MemwyTota
Memoy
Resetved
WApplHSUcatonsCluster
Nodes
MetricsHEWSUSMIACCBTO
SAVIGActweNodes
Decommissioning
Nodes
DecommHioned
Nodes
ost
Nodes
Unhealthy
NodesRUNNITNTEDNG
SchedulCapaciScheduler Metrity
SchedulercTsli
R
RUEeyper
MEMORY)Schedul
ng
ResourceType
Aocat1> on <:AocatonStfedulErShow 20 » entres4> 0»ToolsID• UserC Name: ApplTypecat on: Queue: ApplPriocrtyato n* 伽Timce RnishTIm:e State: RnalStatus: (鬻X: VCores: 瓷豐MB : CPU 兽需MB :Showing0to0of0entresNodataMfableIntable图 1 Apache Hadoop 2.9.2 的 8088 web 端口<-• c © ^5?±l 1^168.134175OO7OXdhhealthTml*tab-<)wv**Overview Master:9000' (active)WM2.92Mar272OusterDTueNov13r826ifb1:1451 *f»0D2O19Cl*4 2Ne31ca687bc2f0420) *ldbcS41b66ed2c67O4yaukafrombwchiW BP-68508M13-19i1lDc^aecl-M4<7292i7% dkectorin. 39bocls = NonConf HMHpMenxMyuMd5lemoryused41.75 MB£2ofM6B1.99o55tfota 1e$y$temo^ects).5M2.B9 )MaxH 6N9onM MDFSUMd:gured Capaciy 26.U3MB(O7emory7GBK unbounded*O3«)图 2 Apache Hadoop 2.9.2 的 50070 端口[lister Metrcs图 3 Apache Hadoop 3.1.1 的 8088 web 端口・76・图 4 Apache Hadoop 3.1.1 的 9870 端口clouderaC (D 刊& 192.168.13.12S7180/cm(/loginmanager图 5 CDH Hadoop 5.16.1 的 7180 管理端口图 6 CDH Hadoop 5.16.1 的 8088 web 端口HadoopOverview hadoop001:8020'(active)CompiM:Thu Nov U I35tt00r716da18M55cd1$037M0en9c904218b03ed19d «0800201SbyenldmfromUnknownSummarySecuriSaf2235emodety»oHe«pfesfta«naoffdrectories.74S bocks «2M3tNonConfHMmpemorygured 45MBof199GBHeapoMtaemory. fwyst MemmoHbfMpMemoiects)ys 199Gay:8136MBof82.99M®Commited Non Hup Memcwy. MaxNon Heapf1.16GB035%)n92G8(8aW图 7 CDH Hadoop 5.16.1 的 50070 端口 2019年第3期综述台 的 功 作 , 重要的是 培 出 优 良 作物种,直接在生产发 种作用与优势。3.3构建Hadoop作物资源评价利用平台作物种质资源(亦称品种资源、 资源或基资源)是发展的战略性资源,是作物育种、农业生 发展的基础,是国家食物安全重要保证和重要 图8 CDH Hadoop 5.16.1的管理环境以上过程,完成了西藏农业大数据平台基础应 台环境的搭建。2. 4 基于 Apache Hadoop 和 CDH Hadoop 功能对比 对比 Apache Hadoop 2. 9. 2、Apache Hadoop 3.1.1和CDH Hadoop 5. 16. 1三个平台环境。 发现Apache Hadoop环境 更新完善、功 拓展,其优点是拓展功 。CDH Hadoop是基于稳定Apache Hadoop开发出稳定、直接 生产环境的平台, 有完善的后台管理及平台拓展功。只要 性能好, 接部署利用环境,优点明显。3 基于Hadoop大数据平台与西藏农 业大数据应用的构想在完成的Hadoop大数据平台搭建基础上,通过 词统 功能我们发现,Htoop大据功 大。 引入到西藏农业生产与科研中,必 重要的作用。针 西藏农业生产, Hadoop大 据平台,在 几个发 大功能及 信息科学技术作用。3.1构建Hadoop大数据农田基本信息数据资源库 平台西藏全区农业信息数据资源,包括农 的土 壤、 、资源情况, Hadoop大据功 出 的等级, 出农 ,便于管理部门直接安 的作物、播种 、适宜栽培的品种 据资源信息。3.2构建Htoop作物育种化信息平台优良的作物品种,是农牧 取 效收入 的好坏。作物 种单位,必须要从海量的优良性状中寻找出适合于生产的栽培品种。 过Hrdoop大据管理平台,通过大的 功能,模拟 配制出多种作物育种组合,指导与辅助育种家加快 与缩短育种周期、 干 合,筛选出生产中需要 的优 作物 合, 功 作物 种 , 发资源,同信息资源一样具有战略重要性 在重要+⑺。 过 构建Hadoop作物资源评 用台, 资源进行多重评价与 ,可农业生 ,从 资源、发现资源的 。3. 4构建Hadoop作物种植模型和农业物联网管理台农业物联网,实 农业生产中大田作物,实现全程管理控制。实 作物生长环境,温、湿、pH 、 、土壤 、CO2 - 土壤 、农进行实时数据采集,实 农业物联网可控 功能+⑻。 过Hadoop大 据评判功能。通过数据 的 、比对功 , 推测出作物种植模型。从发挥出Hadoop大 据平台。3.5构建Hadoop农业智 量预测平台Hadoop大 据农田基本信息数据资源,结 合 据资源,同时 Hadoop 测功能,根据西藏区情,合理的对作物 测,得出科学结论,为市场、农 工、作物 政 策大数据科学技术支撑。3.6 构建Htoop农业人工智能推理管理应用平台 合西藏实际, 农业领域人工智能,大 发展青棵 作物,把青棵作为优先发展的 安全作物,将青棵安全掌握农业科研人员自己的手 中+19] o从 Hadoop大 据与农业人工智能技术合,促进西藏农业产业 、促进青棵产品加工升级,实 西藏农牧 ,实 农业经济发展的,推西藏农业生产大发展。3.7构建Htoop农业防灾抗灾管理应用平台由于西藏自然地理 ,导致农业自然灾发生,严重制约着农业生 农业发展。极易成灾,且灾种 、 域广、破坏 大。西藏的自然灾 主要 :干旱灾害、雪灾、霜灾、冰雹灾害、洪涝灾害、风灾 震灾害+ 20,o 灾是青藏 发生频 、损 大的自然灾害,其中西藏山南地区,另一个是青海南部和四川西北交界地 区,为2个 发中心;西藏那曲南部、日喀则北部、拉 萨周边地区,昌 东北部及青海、四川与西藏交是2个旱灾多发区,是干旱多发自然灾害区;青藏・77・ 综述 2019年第3期涝灾害发生频 大;青藏 、 ,但是 大,特别+ J]. 2018(100$ :689 -713. https://doi. ore/10. 1007/s00607 - 018 -0594 -9.是洪涝引起的崩塌、滑坡、泥石流 生灾害影响很是我国大风、雷电、冰雹灾害发生次数大的地区,夏是集中发生期+川。+ 5 ]杨玉琴,陈桂芬,郭宏亮,等•大数据处理技术在土壤肥力评价中 的研究[J] •中国农机化学报,2016(4$ :233 -236.+ 6]顾军林.大数据在农业无人机上的应用研究+ J] •农机化研究, 2019(4$ :213 -217.此构建Hadoop农业防灾抗灾管理 台,有效的 种频发的自然灾害, 、获 是避免+ 7]洪礼,张云华.海量农业数据云平台的研究+ J] •工业控制计算 机,2015 (3 $ :151 -152.农业生产中的各种灾害,从 有效的保障农业生产,获取最大的生物学 西藏农业 大经济收入,实现+ 8 ]王健飞,潘芳,潘郁.基于Hadoop的农产品安全监控平台的设计 + J] •计算机测量与控制,2015,23 (12$ :4049 -4051,4096.。+ 9]汪浩,王文生,冯阳.基于Hadoop的农技推广数据存储平台设计 4小结与展望Hadoop大据信息技术 ,必 西藏农业 生产与 生积极的影响,同时 西藏农业研究工作、研究 ,带来技术与 ,势必加快在西藏农业 技术 ,实 信息技术“ 车”技术效果。但在西藏农业建设 过程中,主要是克服农业信息人 伍西藏农业发展与建设的 。目前,从 西藏农业科研工作 , “十九大”报告要求,/西藏自治区“十三五”科技 规》,抓住“ ”、实“互网+”, “网络强省、智 农业、 农业、大数据农业、人工智能农业、物 网农业”等技术 ,一 实现“网 天路”,速西藏农业实现快速发展、促进业模式 ,推 业加工 , 西藏农业农业生 。参考文献:+1 ] 2013 年:世界"大数据元年"+ EB/OL]. news, ifeng. com/ eundone/detaii. - 2013 - 12/26/32482247_0• shtmt.+ 2]2013 大数据元年 + EB/OL]. http://cpc. people. com. cn/n/2013/ 1225/c83083 -23940252. htmf 2018 -12-11.[3 ]黎玲萍,毛克彪,付秀丽,等•国内外农业大数据应用研究分析 [J] •高技术通讯,2016,4 :414-422.+ 4 ] Assem H . 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