2024年4月13日发(作者:)
CTAB法原理 CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴
化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高
离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉
淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分
离出来。
CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,在于液相
中; CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;
β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除
PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多
酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?
使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA
联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而
DNA溶于水相。
使用酚的优点:1.有效变性蛋白质;2抑制了DNase的降解作用。缺点:1.能溶解
10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2.不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?
氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?
异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减
少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋
白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+
中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
简言之,无论哪种抽提方法,药品的作用基本都是一样的
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TE Buffer 配制: 10 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0) 1 mmol/L EDTA(pH 8.0) 因为含有
以上两种物质,所以称为TE。 作用: TE缓冲液是弱碱性,对DNA的碱基有保护性,(DNA
在它是的稳定性较好,不易破坏其完整性或产生开环及断裂),包括提取好的DNA也要放在
TE缓冲液是保存.
抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?
酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分
子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。经过离心,变性蛋白质
的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA
分开。而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。作为表面变性的酚与氯仿,在去除
蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~
15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效
果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果
最好。经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次
变性蛋白质,此时一起将酚带走。也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?
在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气
泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过
程中的泡沫产生。一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。也可采用酚、氯仿与异戊醇之比
为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同
时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳
定。
呃……能说下具体的改动部分吗?一般来说,改良法是应用于多年生植物组织的DNA
提取,含有较多的酚,多糖,硅质等,棉花和水稻的DNA提取也需要一定的修改。思路
有两个,一方面尽量去除杂质、蛋白和脂类,另一方面加强DNA的沉淀效果。CTAB在高
离子强度的溶液中可以与蛋白质、多糖等物质结合,而不与DNA结合,这里还可以添加
一些还原剂比如β-巯基乙醇来避免褐化物质对DNA的影响。氯仿-异戊醇可以进一步使蛋
白质变性分层并去除脂类。最后用低温预冷的无水乙醇或者异戊醇来沉淀DNA。
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