第16章 Southern杂交技术

第16章 Southern杂交技术


2024年4月11日发(作者:)

第16章 Southern杂交技术

根据核酸变性与复性的特性,特定核苷酸序列的单链DNA或RNA能够在一定条件下与具

有互补性的核酸链退火形成双链结构,称之为核酸杂交。将已知的特定核苷酸序列的单链DNA

或RNA进行标记,制成核酸探针,就可以用它检测样品中是否存在同源序列,或确定不同物种

之间的亲缘关系,已成为分子生物学中一类重要的检测手段,在科学研究和实践中具有十分广

泛的用途。它可用于基因组特定DNA序列的定位,测定相关片段的同源性、从cDNA文库、

基因组文库中筛选完整基因等。还可以用于构建DNA分子的酶切图谱和遗传图—指纹分析等。

核酸杂交检测都是在滤膜上进行的,常用的滤膜有尼龙滤膜、硝酸纤维素滤膜等。其基本

过程包括以下几步。首先将待检样品DNA或RNA分子直接点加到滤膜上,或经过凝胶电泳分

离再通过毛细管作用或电导作用被转移到滤膜上,而且是按其在凝胶中的位置原封不动地“吸

印”上去的,这个过程称为核酸印迹(nucleic acid blotting)转移,主要有电泳凝胶核酸印迹

法、斑点和狭线印迹法(dot and slot blotting)、菌落和嗜菌斑印迹法(colony and plaque

blotting);然后将具有核酸印迹的滤膜同带有放射性标记或其它标记的DNA或RNA探针进行

杂交。最后,经过放射自显影技术或光化学、免疫学技术显示出不同的颜色,根据颜色的有无

和深浅判定结果。

根据操作方式和检测对象的不同,核酸杂交技术主要有以下几种:斑点杂交技术(Dot

blot)、Southern杂交技术(Southern blot)、Northern杂交技术(Northern blot)。前两

者用于检测DNA,后者用于检测RNA。本章主要介绍Southern杂交技术及其与斑点杂交技术

的不同点。而Northern杂交技术将在第17章介绍。

16.1主要内容

1. Southern Blot方法的原理。

2. DNA琼脂糖凝胶电泳。

3. DNA转移至硝酸纤维素膜及膜处理。

4. 介绍随机引物法标记DNA探针,Southern blot的预杂交、杂交及显色过程。

16.2目的要求

掌握Southern blot方法的原理;掌握随机引物法标记DNA探针,印迹法转移DNA至硝

酸纤维素膜及膜处理。

16.3 实验原理

Southern杂交技术是由Edward M. Southern在1975年首先发明的用于检测DNA的一

种核酸杂交技术,并因此而得名。其原理是根据毛细管作用的原理,将在电泳凝胶中分离的DNA

片段转移并结合在适当的滤膜上,然后通过与标记的单链DNA或RNA探针的杂交作用,检测

这些被转移的DNA片段。

主要步骤包括将基因组DNA进行限制性内切酶消化,琼脂糖凝胶电泳分离,经碱变性等预

处理之后,平铺在已用电泳缓冲液饱和了的两张滤纸上,在凝胶上部覆盖一张硝酸纤维素滤膜,

接着加一叠干滤纸,然后再压盖一重物。由于干滤纸的吸引作用,凝胶中的单链DNA便随电泳

缓冲液一起转移。这些DNA分子一旦与硝酸纤维素滤膜接触,便会牢牢地与之结合,而且是严

格按照它们在凝胶中的谱带模式,原样地被吸印到滤膜上。在80℃下烘烤12h,DNA片段就

会被稳定地固定在硝酸纤维素滤膜上。然后将此滤膜移放在加有标记探针的溶液中进行核酸杂


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